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Enregistrement W3199519791 · doi:10.7191/jeslib.2021.1206

Computational Reproducibility: A Practical Framework for Data Curators

2021· article· en· W3199519791 sur OpenAlexaffabout
Sandra Sawchuk, Shahira Khair

Notice bibliographique

RevueJournal of eScience Librarianship · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueScientific Computing and Data Management
Établissements canadiensUniversity of VictoriaMount Saint Vincent University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReproducibilityData curationComputer scienceData scienceFocus (optics)Best practiceChemistryPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: This paper presents concrete and actionable steps to guide researchers, data curators, and data managers in improving their understanding and practice of computational reproducibility. Objectives: Focusing on incremental progress rather than prescriptive rules, researchers and curators can build their knowledge and skills as the need arises. This paper presents a framework of incremental curation for reproducibility to support open science objectives. Methods: A computational reproducibility framework developed for the Canadian Data Curation Forum serves as the model for this approach. This framework combines learning about reproducibility with recommended steps to improving reproducibility. Conclusion: Computational reproducibility leads to more transparent and accurate research. The authors warn that fear of a crisis and focus on perfection should not prevent curation that may be ‘good enough.’

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,548
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,609
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,982
Score d'incertitude au seuil0,557

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,5480,609
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0160,011
Études des sciences et des technologies0,0160,052
Communication savante0,0320,042
Science ouverte0,0180,035
Intégrité de la recherche0,0130,017
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,569
Tête enseignante GPT0,514
Écart entre enseignants0,055 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineReproductibilité
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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