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Enregistrement W3199629348 · doi:10.1139/cjfas-2020-0352

<i>Myxobolus cerebralis</i> establishment and spread: a graphical synthesis

2021· article· en· W3199629348 sur OpenAlexaffvenue
Pouria Ramazi, Samuel Fischer, Julie D. Alexander, Clayton James, Andrew J. Paul, Russell Greiner, Mark A. Lewis

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMyxozoan Parasites in Aquatic Species
Établissements canadiensCochraneGovernment of CanadaFisheries and Oceans CanadaUniversity of AlbertaAlberta Environment and Protected AreasBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGraphical modelComputer scienceGraphTheoretical computer scienceEcologyData scienceArtificial intelligenceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myxobolus cerebralis is the parasite causing whirling disease, which has dramatic ecological impacts due to its potential to cause high mortality in salmonids. The large-scale efforts, necessary to underpin an effective surveillance program, have practical and economic constraints. There is, hence, a clear need for models that can predict the parasite spread. Model development, however, often heavily depends on knowing influential variables and governing mechanisms. We have developed a graphical model for the establishment and spread of M. cerebralis by synthesizing experts’ opinion and empirical studies. First, we conducted a series of workshops with experts to identify variables believed to impact the establishment and spread of the parasite M. cerebralis and visualized their interactions via a directed acyclic graph. Then we refined the graph by incorporating empirical findings from the literature. The final graph’s nodes correspond to variables whose considerable impact on M. cerebralis establishment and spread is either supported by empirical data or confirmed by experts, and the graph’s directed edges represent direct causality or strong correlation. This graphical model facilitates communication and education of whirling disease and provides an empirically driven framework for constructing future models, especially Bayesian networks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,062

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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