MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3201165649 · doi:10.1101/2021.09.17.460684

Kalium rhodopsins: Natural light-gated potassium channels

2021· preprint· en· W3201165649 sur OpenAlexafffund
Elena G. Govorunova, Yueyang Gou, Oleg A. Sineshchekov, Hai Li, Yumei Wang, Leonid S. Brown, Mingshan Xue, John L. Spudich

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésOptogeneticsChannelrhodopsinPotassium channelBiophysicsPotassiumChemistryCell permeabilityNeuroscienceBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We report a family of K + channels, kalium channelrhodopsins (KCRs) from a fungus-like protist. Previously known potassium channels, widespread and mainly ligand- or voltage-gated, share a conserved pore-forming domain and K + -selectivity filter. KCRs differ in that they are light-gated and they have independently evolved an alternative K + selectivity mechanism. The KCRs are potent, highly selective of K + over Na + , and open in less than 1 millisecond following photoactivation. Their permeability ratio P K /P Na of ∼ 20 make KCRs powerful hyperpolarizing tools that suppress excitable cell firing upon illumination, demonstrated here in mouse cortical neurons. KCRs enable specific optogenetic photocontrol of K + gradients promising for the study and potential treatment of potassium channelopathies such as epilepsy, Parkinson’s disease, and long-QT syndrome and other cardiac arrhythmias. One-Sentence Summary Potassium-selective channelrhodopsins long-sought for optogenetic research and therapy of neurological and cardiac diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Communication savante, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetPhotoreceptor and optogenetics researchTravaux en français237 207