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Enregistrement W3201615812 · doi:10.1101/2021.09.14.460246

Prolific Induction of IL-6 in Human Cells by SARS-CoV-2-derived Peptide is Attenuated by Recombinant Human Anti-inflammatory Cytokines made <i>in planta</i>

2021· preprint· en· W3201615812 sur OpenAlexafffund
Pieter H. Anborgh, Igor Kolotilin, Nisha A. Owens, Abdulla Mahboob

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensFanshawe College
Organismes subventionnairesFedDev OntarioCompute Canada
Mots-clésImmune systemCytokineSecretionRecombinant DNACytotoxic T cellCell cultureBiologyPeptideInterleukinCancer researchInflammationImmunologyInternal medicineMolecular biologyMedicineEndocrinologyGeneBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Development of efficient therapies for COVID-19 is the focus of intense research. The cytokine release syndrome was underlined as a culprit for severe outcomes in COVID-19 patients. Interleukin-6 (IL-6) plays a crucial role in human immune responses and elevated IL-6 plasma levels have been associated with the exacerbated COVID-19 pathology. Since non-structural protein 10 (NSP10) of SARS-CoV-2 has been implicated in the induction of IL-6, we designed Peptide (P)1, containing sequences corresponding to amino acids 68-96 of NSP10, and examined its effect on cultured human cells. Treatment with P1 strongly increased IL-6 secretion by the lung cancer cell line NCI-H1792 and the breast cancer cell line MDA-MB-231 and revealed profound cytotoxic activity on Caco-2 colorectal adenocarcinoma cells. Treatment with P2, harbouring a mutation in the zinc knuckle motif of NSP10, caused no IL-6 induction and no cytotoxicity. Pre-treatment with plant-produced human anti-inflammatory cytokines IL-37b and IL-38 effectively mitigated the induction of IL-6 secretion. Our results suggest a role for the zinc knuckle motif of NSP10 in the onset of increased IL-6 plasma levels of COVID-19 patients and for IL-37b and IL-38 as therapeutics aimed at attenuating the cytokine release syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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