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Enregistrement W3201863729 · doi:10.2196/20028

Open-source Software Sustainability Models: Initial White Paper From the Informatics Technology for Cancer Research Sustainability and Industry Partnership Working Group

2021· review· en· W3201863729 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Internet Research · 2021
Typereview
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueOpen Source Software Innovations
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute for Occupational Safety and HealthU.S. National Library of MedicineNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCenters for Disease Control and PreventionInstituto Tecnológico de Costa RicaUniversity of PittsburghNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthUniversity of Chicago
Mots-clésSustainabilityDocumentationKnowledge managementHealth informaticsGeneral partnershipBusinessProcess managementComputer scienceMedicinePublic healthNursing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The National Cancer Institute Informatics Technology for Cancer Research (ITCR) program provides a series of funding mechanisms to create an ecosystem of open-source software (OSS) that serves the needs of cancer research. As the ITCR ecosystem substantially grows, it faces the challenge of the long-term sustainability of the software being developed by ITCR grantees. To address this challenge, the ITCR sustainability and industry partnership working group (SIP-WG) was convened in 2019. OBJECTIVE: The charter of the SIP-WG is to investigate options to enhance the long-term sustainability of the OSS being developed by ITCR, in part by developing a collection of business model archetypes that can serve as sustainability plans for ITCR OSS development initiatives. The working group assembled models from the ITCR program, from other studies, and from the engagement of its extensive network of relationships with other organizations (eg, Chan Zuckerberg Initiative, Open Source Initiative, and Software Sustainability Institute) in support of this objective. METHODS: This paper reviews the existing sustainability models and describes 10 OSS use cases disseminated by the SIP-WG and others, including 3D Slicer, Bioconductor, Cytoscape, Globus, i2b2 (Informatics for Integrating Biology and the Bedside) and tranSMART, Insight Toolkit, Linux, Observational Health Data Sciences and Informatics tools, R, and REDCap (Research Electronic Data Capture), in 10 sustainability aspects: governance, documentation, code quality, support, ecosystem collaboration, security, legal, finance, marketing, and dependency hygiene. RESULTS: Information available to the public reveals that all 10 OSS have effective governance, comprehensive documentation, high code quality, reliable dependency hygiene, strong user and developer support, and active marketing. These OSS include a variety of licensing models (eg, general public license version 2, general public license version 3, Berkeley Software Distribution, and Apache 3) and financial models (eg, federal research funding, industry and membership support, and commercial support). However, detailed information on ecosystem collaboration and security is not publicly provided by most OSS. CONCLUSIONS: We recommend 6 essential attributes for research software: alignment with unmet scientific needs, a dedicated development team, a vibrant user community, a feasible licensing model, a sustainable financial model, and effective product management. We also stress important actions to be considered in future ITCR activities that involve the discussion of the sustainability and licensing models for ITCR OSS, the establishment of a central library, the allocation of consulting resources to code quality control, ecosystem collaboration, security, and dependency hygiene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,053
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,055
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Communication savante, Science ouverte, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesMétarecherche, Science ouverte, Intégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,959
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0530,055
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,005
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0150,017
Intégrité de la recherche0,0020,018
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,254
Tête enseignante GPT0,514
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle