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Enregistrement W3202927809 · doi:10.1038/s41597-021-01006-6

AusTraits, a curated plant trait database for the Australian flora

2021· article· en· W3202927809 sur OpenAlexaff
Daniel S. Falster, Rachael V. Gallagher, Elizabeth Wenk, Ian J. Wright, Dony Indiarto, Samuel C. Andrew, Caitlan Baxter, James R. Lawson, Stuart Allen, Anne Fuchs, Anna M. Monro, Fonti Kar, Mark A. Adams, Collin W. Ahrens, Matthew Alfonzetti, Tara Angevin, Deborah M. G. Apgaua, Stefan K. Arndt, Owen K. Atkin, Joe Atkinson, Tony D. Auld, Andrew G. Baker, Maria von Balthazar, A. R. Bean, Chris J. Blackman, Keith J. Bloomfield, David M. J. S. Bowman, Jason G. Bragg, Timothy J. Brodribb, Genevieve Buckton, Geoff Burrows, Elizabeth Caldwell, James Camac, Raymond J. Carpenter, Jane A. Catford, Gregory R. Cawthray, Lucas A. Cernusak, Gregory Chandler, Alex R. Chapman, David Cheal, Alexander W. Cheesman, Si-Chong Chen, Brendan Choat, Brook Clinton, Peta L. Clode, Helen G. Coleman, William K. Cornwell, Meredith Cosgrove, Michael D. Crisp, Erika Cross, Kristine Y. Crous, Saul A. Cunningham, Timothy J. Curran, Ellen M. Curtis, Matthew I. Daws, Jane L. DeGabriel, Matthew D. Denton, Ning Dong, Pengzhen Du, Honglang Duan, David H. Duncan, Richard P. Duncan, Marco F. Duretto, John M. Dwyer, C.R. Edwards, Manuel Esperón‐Rodríguez, John R. Evans, Susan E. Everingham, Claire Farrell, Jennifer Firn, Carlos Roberto Fonseca, Ben J. French, Doug Frood, Jennifer L. Funk, Sonya R. Geange, Oula Ghannoum, Sean M. Gleason, Carl R. Gosper, Emma F. Gray, Philip K. Groom, Saskia Grootemaat, C. L. Gross, Greg R. Guerin, Lydia K. Guja, Amy K. Hahs, Matthew Tom Harrison, Patrick E. Hayes, Martin L. Henery, Dieter F. Hochuli, Jocelyn Howell, Guomin Huang, Lesley Hughes, John M. Huisman, Jugoslav Ilic, Ashika Jagdish, Daniel Jin, Gregory J. Jordan, Enrique Jurado, John Kanowski, Sabine Kasel, Jürgen Kellermann, Belinda Kenny, Michele Kohout, Robert M. Kooyman, Martyna M. Kotowska, Hao Ran Lai, Étienne Laliberté, Hans Lambers, Byron B. Lamont, Robert Lanfear, Frank van Langevelde, Daniel C. Laughlin, Bree-Anne Laugier-Kitchener, Susan G. W. Laurance, Caroline E. R. Lehmann, Andrea Leigh, Michelle R. Leishman, Tanja I. Lenz, Brendan J. Lepschi, James D. Lewis, Felix K. S. Lim, Udayangani Liu, Janice M. Lord, Christopher H. Lusk, Cate Macinnis‐Ng, Hannah McPherson, Susana Magallón, Anthony Manea, Andrea M. López‐Martínez, Margaret M. Mayfield, James K. McCarthy, Trevor L. Meers, Marlien van der Merwe, Daniel J. Metcalfe, Per Milberg, Karel Mokany, Angela T. Moles, Ben D. Moore, Nicholas Moore, John W. Morgan, William K. Morris, Annette Muir, Samantha Munroe, Áine Nicholson, Dean Nicolle, Adrienne B. Nicotra, Ülo Niinemets, Tom North, Andrew O’Reilly‐Nugent, Odhran S. O’Sullivan, Brad Oberle, Yusuke Onoda, Mark K. J. Ooi, Colin P. Osborne, Grazyna Paczkowska, Burak K. Pekin, Caio Guilherme Pereira, Catherine Marina Pickering, Melinda Pickup, Laura J. Pollock, Pieter Poot, Jeff R. Powell, Sally A. Power, I. Colin Prentice, Lynda D. Prior, Suzanne M. Prober, Jennifer Read, Victoria Reynolds, Anna E. Richards, Ben Richardson, Michael L. Roderick, Julieta A. Rosell, Maurizio Rossetto, Barbara Lynette Rye, Paul D. Rymer, Michael A. Sams, Gordon D. Sanson, Hervé Sauquet, Susanne Schmidt, Jürg Schönenberger, Ernst‐Detlef Schulze, Kerrie M. Sendall, Steve J. Sinclair, Benjamin Smith, Renee Smith, Fiona M. Soper, Ben Sparrow, Rachel J. Standish, Timothy L. Staples, Ruby E. Stephens, Christopher Szota, Guy M. Taseski, Elizabeth M. Tasker, Freya Thomas, David T. Tissue, Mark G. Tjoelker, David Y. P. Tng, Félix de Tombeur, Kyle W. Tomlinson, Neil C. Turner, Erik J. Veneklaas, Susanna Venn, Peter A. Vesk, Carolyn Vlasveld, Maria S. Vorontsova, Nigel W. M. Warwick, Lasantha K. Weerasinghe, Jessie A. Wells, Mark Westoby, Matthew White, Nicholas S. G. Williams, Jarrah Wills, Peter G. Wilson, Colin J. Yates, Amy E. Zanne, Graham Zemunik, Kasia Ziemińska

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesAustralian Research Data CommonsNSW Department of Planning,Industry and EnvironmentAustralian Research CouncilSoochow UniversityDepartment of Biodiversity, Conservation and AttractionsCentre for Australian National Biodiversity ResearchDepartment of Education and TrainingDepartment of Environment, Land, Water and Planning, State Government of Victoria
Mots-clésTaxonTraitScope (computer science)BiologyDatabaseEcologyFlora (microbiology)Field (mathematics)Taxonomic rankGeographyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We introduce the AusTraits database - a compilation of values of plant traits for taxa in the Australian flora (hereafter AusTraits). AusTraits synthesises data on 448 traits across 28,640 taxa from field campaigns, published literature, taxonomic monographs, and individual taxon descriptions. Traits vary in scope from physiological measures of performance (e.g. photosynthetic gas exchange, water-use efficiency) to morphological attributes (e.g. leaf area, seed mass, plant height) which link to aspects of ecological variation. AusTraits contains curated and harmonised individual- and species-level measurements coupled to, where available, contextual information on site properties and experimental conditions. This article provides information on version 3.0.2 of AusTraits which contains data for 997,808 trait-by-taxon combinations. We envision AusTraits as an ongoing collaborative initiative for easily archiving and sharing trait data, which also provides a template for other national or regional initiatives globally to fill persistent gaps in trait knowledge.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,062

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0080,011
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,163
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations199
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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