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Enregistrement W3202968128 · doi:10.1126/scitranslmed.abc0497

Targeting integrated epigenetic and metabolic pathways in lethal childhood PFA ependymomas

2021· article· en· W3202968128 sur OpenAlexaff
Pooja Panwalkar, Benita Tamrazi, Derek Dang, Chan Chung, Stefan R. Sweha, Siva Kumar Natarajan, Matthew Pun, Jill Bayliss, Martin P. Ogrodzinski, Drew Pratt, Brendan Mullan, Debra Hawes, Fusheng Yang, Chao Lü, Benjamin R. Sabari, Abhinav Achreja, Jin Heon, Olamide Animasahun, Marcin Cieślik, Christopher Dunham, Stephen Yip, Juliette Hukin, Joanna J. Phillips, Miriam Bornhorst, Andrea M. Griesinger, Andrew M. Donson, Nicholas K. Foreman, Hugh Garton, Jason Heth, Karin M. Muraszko, Javad Nazarian, Carl Koschmann, Li Jiang, Mariella G. Filbin, Deepak Nagrath, Marcel Kool, Andrey Korshunov, Stefan M. Pfister, Richard J. Gilbertson, C. David Allis, Arul M. Chinnaiyan, Sophia Y. Lunt, Stefan Blüml, Alexander R. Judkins, Sriram Venneti

Notice bibliographique

RevueScience Translational Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteEMD SeronoNational Institutes of HealthUniversity of California, San FranciscoRobert Connor Dawes FoundationCancer Research UKIncyteCERNRudi Schulte Research InstituteChildren's Hospital Los AngelesIan's Friends FoundationAmgenA. Alfred Taubman Medical Research InstituteAstraZenecaPfizerHyundai Hope On WheelsDamon Runyon Cancer Research Foundation
Mots-clésEpigeneticsMetabolic pathwayEpendymomaBiologyCancer researchEpigenesisPosterior fossaMedicineBioinformaticsNeuroscienceComputational biologyGeneticsDNA methylationPathologyGeneAnatomyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

, a key component of the metabolic regulator AMP-activated protein kinase (AMPK), also showed H3K27ac enrichment in PFAs and EZHIP-WT NSCs. The AMPK activator metformin lowered EZHIP protein concentrations, increased H3K27me3, suppressed TCA cycle metabolism, and showed therapeutic efficacy in vitro and in vivo in patient-derived PFA xenografts in mice. Our data indicate that PFAs and EZHIP-WT–expressing NSCs are characterized by enhanced glycolysis and TCA cycle metabolism. Repurposing the antidiabetic drug metformin lowered pathogenic EZHIP, increased H3K27me3, and suppressed tumor growth, suggesting that targeting integrated metabolic/epigenetic pathways is a potential therapeutic strategy for treating childhood ependymomas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,456
Score d'incertitude au seuil0,420

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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