MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3205576405 · doi:10.1186/s12935-021-02201-6

Huanglianjiedu Decoction as an effective treatment for oral squamous cell carcinoma based on network pharmacology and experimental validation

2021· article· en· W3205576405 sur OpenAlexaff
Lejun Zhang, Zhaoting Ling, Zhengqiang Hu, Guanmin Meng, Xinqiang Zhu, Huifang Tang

Notice bibliographique

RevueCancer Cell International · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFlavonoids in Medical Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesZhejiang UniversityNatural Science Foundation of Zhejiang ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésScutellaria baicalensisCoptis chinensisKEGGGardenia jasminoidesCell cycleMAPK/ERK pathwayCell growthPI3K/AKT/mTOR pathwayTraditional medicineCoptisApoptosisCancer researchBiologyPTENKinaseMedicineTraditional Chinese medicineTranscriptomeGeneCell biologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is one of malignant tumors in oral and maxillofacial region with high fatality. Huanglianjiedu Decoction (HLJDD) is a well-known traditional Chinese medicinal prescription, which consists of Coptis chinensis Franch, Scutellaria baicalensis Georgi, Phellodendron amurense Rupr and Gardenia jasminoides J.Ellis. Some clinical studies showed HLJDD had good effectiveness on OSCC, but the mechanism is unclear. METHODS: In this study, potential components of HLJDD and putative targets were screened by Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP). Combining with potential targets of OSCC searched from Therapeutic Target Database (TTD) and Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM), we drew protein-protein interaction (PPI) network by Cytoscape v3.2.0 software. After topological analysis we got core targets and further did Gene Ontology (GO) enrichment and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analysis. Then we did the in vitro experiments to verify the major biological processes (cell cycle, apoptosis and proliferation) and signaling pathways (mitogen-activated protein kinase (MAPK), nuclear factor-kappa B (NF-κB), protein kinase B (AKT)) on OSCC cell lines, SCC-25 and CAL-27. RESULTS: The potential component targets number of Coptis chinensis Franch, Scutellaria baicalensis Georgi, Phellodendron amurense Rupr and Gardenia jasminoides J.Ellis were 39, 93, 81and 88, respectively. Then we got 52 core targets which enriched in cell cycle, apoptosis, proliferation, MAPK activation etc. and obtained TOP30 pathways. On SCC-25 and CAL-27, HLJDD suppressed cell proliferation, induced late apoptosis and inhibited cell invasion and migration which were consistent with the results from network pharmacology analysis. Additionally, in cell cycle, we confirmed HLJDD inhibited G1 phase and arrested in S phase to reduce cell proliferation on SCC-25. In signaling pathways, HLJDD inhibited the phosphorylation of extracellular regulatory protein kinase 1/2 (ERK1/2) and NF-κB p65 (S468) on SCC-25 and CAL-27. CONCLUSIONS: HLJDD played a potential therapeutic role on OSCC via inhibiting p-ERK1/2 and p-NF-κB p65 (S468).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,413
Écart entre enseignants0,380 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Cell InternationalMême sujetFlavonoids in Medical ResearchTravaux en français237 207