MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3207592456 · doi:10.1016/j.jtho.2021.09.008

Lung Cancer Driven by BRAFG469V Mutation Is Targetable by EGFR Kinase Inhibitors

2021· article· en· W3207592456 sur OpenAlexafffund
Ku-Geng Huo, Hirotsugu Notsuda, Zhenhao Fang, Ningdi Feng Liu, Teklab Gebregiworgis, Quan Li, Nhu‐An Pham, Ming Li, Geoffrey Liu, Frances A. Shepherd, Christopher B. Marshall, Mitsuhiko Ikura, Nadeem Moghal, Ming‐Sound Tsao

Notice bibliographique

RevueJournal of Thoracic Oncology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox FoundationCompute CanadaPrincess Margaret Cancer FoundationCanadian Cancer SocietyAstraZeneca
Mots-clésCancer researchOsimertinibGefitinibTrametinibMedicineGene knockdownCrizotinibDabrafenibTyrosine kinaseVemurafenibSmall interfering RNAKinaseErlotinibLung cancerEpidermal growth factor receptorMutationTargeted therapyCancerBiologyCell cultureOncologyMAPK/ERK pathwayInternal medicineGeneMelanomaTransfectionReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Mutations in BRAF occur in 2% to 4% of patients with lung adenocarcinoma. Combination dabrafenib and trametinib, or single-agent vemurafenib is approved only for patients with cancers driven by the V600E BRAF mutation. Targeted therapy is not currently available for patients harboring non-V600 BRAF mutations. Methods A lung adenocarcinoma patient-derived xenograft model (PHLC12) with wild-type and nonamplified EGFR was tested for response to EGFR tyrosine kinase inhibitors (TKIs). A cell line derived from this model (X12CL) was also used to evaluate drug sensitivity and to identify potential drivers by small interfering RNA knockdown. Kinase assays were used to test direct targeting of the candidate driver by the EGFR TKIs. Structural modeling including, molecular dynamics simulations, and binding assays were conducted to explore the mechanism of off-target inhibition by EGFR TKIs on the model 12 driver. Results Both patient-derived xenograft PHLC12 and the X12CL cell line were sensitive to multiple EGFR TKIs. The BRAF G469V mutation was found to be the only known oncogenic mutation in this model. Small interfering RNA knockdown of BRAF, but not the EGFR, killed X12CL, confirming BRAF G469V as the oncogenic driver. Kinase activity of the BRAF protein isolated from X12CL was inhibited by treatment with the EGFR TKIs gefitinib and osimertinib, and expression of BRAF G469V in non–EGFR–expressing NR6 cells promoted growth in low serum condition, which was also sensitive to EGFR TKIs. Structural modeling, molecular dynamic simulations, and in vitro binding assays support BRAF G469V being a direct target of the TKIs. Conclusions Clinically approved EGFR TKIs can be repurposed to treat patients with non-small cell lung cancer harboring the BRAF G469V mutation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,416 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Thoracic OncologyMême sujetLung Cancer Treatments and MutationsTravaux en français237 207