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Enregistrement W3207745777 · doi:10.1117/12.2601143

Simplified gluten detection approach in the presence of a black hole quencher (BHQ)

2021· article· en· W3207745777 sur OpenAlexaff
Samaria Nevarez Diaz, Orly Yadid-Pecht, Varun Vij, Raymond J. Turner

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFörster resonance energy transferFluorophoreBiosensorConjugateCovalent bondChemistryFluorescenceGliadinConjugated systemReagentCombinatorial chemistryQuenching (fluorescence)GrapheneFluoresceinGlutenChromatographyNanotechnologyMaterials scienceOrganic chemistryBiochemistryPolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Optical biosensors based in the fluorescence resonance energy transfer (FRET) phenomenon require of fluorophores. The use of fluorophores requires of a complex optical system that often leads to signal loss. Thus, a new approach based in a Black Hole Quencher (BHQ) that further simplifies the biosensor is sought. This approach potentially increases the sensitivity and accuracy. For the development of this approach, the gliadin conjugate with BHQ-10 must be established first. In the present work, we used the physical phenomenon of FRET to study the gliadin conjugation with BHQ-10 molecule. We performed an experiment with a fluorophore (6-Carboxyfluorescein or 6-FAM) labeled aptamer and non-covalently attached to graphene oxide (GO). The gliadin from gluten was conjugated with BHQ using two different cross-linking reagents present in BHQ: BHQ-10 succinimidyl ester and BHQ-10 carboxylic acid. BHQ-10 with carboxylic acid as the cross-linking reagent demonstrated to be an efficient reaction for gliadin conjugation with BHQ-10. The average quenching efficiency obtained was 62% in comparison to the gliadin as a control experiment. This sets the basis for the breakthrough development of a simplified gluten detection biosensor based on absorbance measurements instead of different wavelength ranges as fluorophores do. The aim is to develop a point-of-care microfluidic system that measures gliadin from gluten in a sensitive, accurate and cost-efficient manner.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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