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Enregistrement W3207796226 · doi:10.1007/s10140-021-01954-x

Limited generalizability of deep learning algorithm for pediatric pneumonia classification on external data

2021· article· en· W3207796226 sur OpenAlexaff
Kevin Xin, David Li, Paul H. Yi

Notice bibliographique

RevueEmergency Radiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 diagnosis using AI
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneralizability theoryMedicineArtificial intelligenceTest setConvolutional neural networkRadiographyReceiver operating characteristicPneumoniaDeep learningData setSet (abstract data type)Test (biology)Machine learningPattern recognition (psychology)RadiologyComputer scienceStatisticsInternal medicineMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: (1) Develop a deep learning system (DLS) to identify pneumonia in pediatric chest radiographs, and (2) evaluate its generalizability by comparing its performance on internal versus external test datasets. METHODS: Radiographs of patients between 1 and 5 years old from the Guangzhou Women and Children's Medical Center (Guangzhou dataset) and NIH ChestXray14 dataset were included. We utilized 5232 radiographs from the Guangzhou dataset to train a ResNet-50 deep convolutional neural network (DCNN) to identify pediatric pneumonia. DCNN testing was performed on a holdout set of 624 radiographs from the Guangzhou dataset (internal test set) and 383 radiographs from the NIH ChestXray14 dataset (external test set). Receiver operating characteristic curves were generated, and area under the curve (AUC) was compared via DeLong parametric method. Colored heatmaps were generated using class activation mapping (CAM) to identify important image pixels for DCNN decision-making. RESULTS: The DCNN achieved AUC of 0.95 and 0.54 for identifying pneumonia on internal and external test sets, respectively (p < 0.0001). Heatmaps generated by the DCNN showed the algorithm focused on clinically relevant features for images from the internal test set, but not for images from the external test set. CONCLUSION: Our model had high performance when tested on an internal dataset but significantly lower accuracy when tested on an external dataset. Likewise, marked differences existed in the clinical relevance of features highlighted by heatmaps generated from internal versus external datasets. This study underscores potential limitations in the generalizability of such DLS models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,046
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,073

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,046
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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