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Enregistrement W3207828649 · doi:10.1021/acschembio.1c00501

Carbohydrate Sulfation As a Mechanism for Fine-Tuning Siglec Ligands

2021· article· en· W3207828649 sur OpenAlex
Jaesoo Jung, Jhon R. Enterina, Duong T. Bui, Fahima Mozaneh, Po‐Han Lin, Nitin Nitin, Chu‐Wei Kuo, Emily Rodrigues, Abhishek Bhattacherjee, Parisa Raeisimakiani, Gour Chand Daskhan, Chris D. St. Laurent, Kay‐Hooi Khoo, Lara K. Mahal, Wesley F. Zandberg, Xuefei Huang, John S. Klassen, Matthew S. Macauley

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueACS Chemical Biology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanada Excellence Research Chairs, Government of CanadaAlberta InnovatesCanada Research ChairsArthritis SocietyNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Alberta
Mots-clésSIGLECSulfationGlycanChemistryBiochemistrySialic acidGlycoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The immunomodulatory family of Siglecs recognizes sialic acid-containing glycans as “self”, which is exploited in cancer for immune evasion. The biochemical nature of Siglec ligands remains incompletely understood, with emerging evidence suggesting the importance of carbohydrate sulfation. Here, we investigate how specific sulfate modifications affect Siglec ligands by overexpressing eight carbohydrate sulfotransferases (CHSTs) in five cell lines. Overexpression of three CHSTs─CHST1, CHST2, or CHST4─significantly enhance the binding of numerous Siglecs. Unexpectedly, two other CHSTs (Gal3ST2 and Gal3ST3) diminish Siglec binding, suggesting a new mode to modulate Siglec ligands via sulfation. Results are cell type dependent, indicating that the context in which sulfated glycans are presented is important. Moreover, a pharmacological blockade of N- and O-glycan maturation reveals a cell-type-specific pattern of importance for either class of glycan. Production of a highly homogeneous Siglec-3 (CD33) fragment enabled a mass-spectrometry-based binding assay to determine ≥8-fold and ≥2-fold enhanced affinity for Neu5Acα2–3(6-O-sulfo)Galβ1–4GlcNAc and Neu5Acα2–3Galβ1–4(6-O-sulfo)GlcNAc, respectively, over Neu5Acα2–3Galβ1–4GlcNAc. CD33 shows significant additivity in affinity (≥28-fold) for the disulfated ligand, Neu5Acα2–3(6-O-sulfo)Galβ1–4(6-O-sulfo)GlcNAc. Moreover, joint overexpression of CHST1 with CHST2 in cells greatly enhanced the binding of CD33 and several other Siglecs. Finally, we reveal that CHST1 is upregulated in numerous cancers, correlating with poorer survival rates and sodium chlorate sensitivity for the binding of Siglecs to cancer cell lines. These results provide new insights into carbohydrate sulfation as a general mechanism for tuning Siglec ligands on cells, including in cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,502

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle