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Enregistrement W3207837394 · doi:10.3390/metabo11100710

Metabolomics Differences of Glycine max QTLs Resistant to Soybean Looper

2021· article· en· W3207837394 sur OpenAlexafffund
Maryam Yousefi‐Taemeh, Jie Lin, Demian R. Ifa, Wayne A. Parrott, Nik Kovinich

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDaidzeinIsoflavonoidQuantitative trait locusMetaboliteBiologyMetabolomicsAlleleIsoflavonesGenotypeGeneticsGlycineSecondary metaboliteGeneGenisteinBiochemistryFlavonoidBioinformaticsAmino acid

Résumé

Quantitative trait loci (QTLs) E and M are major soybean alleles that confer resistance to leaf-chewing insects, and are particularly effective in combination. Flavonoids and/or isoflavonoids are classes of plant secondary metabolites that previous studies agree are the causative agents of resistance of these QTLs. However, all previous studies have compared soybean genotypes that are of dissimilar genetic backgrounds, leaving it questionable what metabolites are a result of the QTL rather than the genetic background. Here, we conducted a non-targeted mass spectrometry approach without liquid chromatography to identify differences in metabolite levels among QTLs E, M, and both (EM) that were introgressed into the background of the susceptible variety Benning. Our results found that E and M mainly confer low-level, global differences in distinct sets of metabolites. The isoflavonoid daidzein was the only metabolite that demonstrated major increases, specifically in insect-treated M and EM. Interestingly, M confers increased daidzein levels in response to insect, whereas E restores M's depleted daidzein levels in the absence of insect. Since daidzein levels do not parallel levels of resistance, our data suggest a novel mechanism that the QTLs confer resistance to insects by mediating changes in hundreds of metabolites, which would be difficult for the insect to evolve tolerance. Collective global metabolite differences conferred by E and M might explain the increased resistance of EM.

Conservé avec la notice de tri, où il sert de preuve aux étiquettes ci-dessus.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Le tri à trois modèles

les 5 600 travaux triés →

Les trois modèles l'ont jugé hors champ.

strate : aff_core · poids de sondage : 5595.24 (l'échantillon est stratifié ; tout taux calculé sans le poids est faux)
Claude Opus 4.8OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Metabolomics of soybean insect resistance QTLs; a plant science question.

GPT-5.6 (high)OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

The study investigates soybean metabolites and insect resistance.

Grok 4.5OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Plant metabolomics of insect-resistance QTLs in soybean is agricultural biology domain research.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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