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Enregistrement W3207936442 · doi:10.1093/jas/skab235.151

154 Virulence Potential of Antimicrobial Resistant Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli from Poultry in a Caenorhabditis Elegans Model

2021· article· en· W3207936442 sur OpenAlexaff
Chongwu Yang, Moussa S. Diarra, Muhammad Attiq Rehman, Linyan Li, Hai Yu, Xianhua Yin, Mueen Aslam, Catherine D. Carrillo, Chengbo Yang, Joshua Gong

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceBiologyCaenorhabditis elegansSerotypeFecesMicrobiologyEscherichia coliAntimicrobialGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This study investigated virulence potential of poultry antimicrobial resistant extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC). A total of 46 E. coli isolates from poultry meat, feces, or humans were sequenced and identified as ExPEC. Based on their characteristics, eight of these ExPEC isolates were evaluated for their potentials using a Caenorhabditis elegans infection model. The life-span of C. elegans in response to these eight isolates was examined in three life-span experiments: 1) E. coli OP 50 (negative control), K88+ enterotoxigenic E. coli strain JG280 (positive control), and an ExPEC isolate from human urinal tract infection; 2) three ExPEC isolates from chicken and turkey retail meats; 3) four ExPEC isolates from chicken feces with different antimicrobial resistance (AMR) profiles or a various number of virulence genes (VGs). All 46 isolates belonged to 24 serotypes among which 6 were of serotype O25:H4 Sequence Type 131 (ST131). Interestingly, all ST 131 isolates from chicken or turkey retail meats clustered with a human UTI isolate belonging to the similar serotype and ST type. The types and numbers of AGRs and VGs varied among the eight selected isolates for C. elegans model. The human ExPEC induced a similar effect as the JG280 on reducing (P < 0.05) survival of C. elegans. Interestingly, chicken and turkey meat ExPEC isolates, caused similar negative impacts on the survival of worms as the human ExPEC. Additionally, fecal ExPEC isolates reduced (P < 0.05) the survival of C. elegans compared to OP50. However, the survival of C. elegans was not reduced with an increasing number of VGs and did not seem to be affected by AMR profiles. This study indicated the virulence potential of ExPEC isolates from retail poultry meat or feces. The relationship between specific AMR profiles and/or numbers of VGs with pathogenicity in these E. coli isolates deserves further investigations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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