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Enregistrement W3208200442 · doi:10.1084/jem.20211872

<i>Dnmt3a</i> -mutated clonal hematopoiesis promotes osteoporosis

2021· article· en· W3208200442 sur OpenAlexafffund
Peter G. Kim, Abhishek Niroula, Veronica Shkolnik, Marie McConkey, Mikołaj Słabicki, John P. Kemp, Alexander G. Bick, Christopher J. Gibson, Gabriel K. Griffin, Aswin Sekar, Daniel J. Brooks, Waihay J. Wong, Drew N. Cohen, Md Mesbah Uddin, Wesley Shin, James P. Pirruccello, Jonathan M. Tsai, Mridul Agrawal, Douglas P. Kiel, Mary Bouxsein, J. Brent Richards, David M. Evans, Marc N. Wein, Julia F. Charles, Siddhartha Jaiswal, Pradeep Natarajan, Benjamin L. Ebert

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteLady Davis Institute for Medical ResearchNational Heart, Lung, and Blood InstituteBrigham Research InstituteNational Institutes of HealthFondation de l'Hôpital général juifJewish General HospitalKnut och Alice Wallenbergs StiftelseAmerican Society of HematologyCancer Research UKMcGill UniversityPublic Health Agency of CanadaFondation LeducqEdward P. Evans FoundationCanadian Institutes of Health ResearchDamon Runyon Cancer Research FoundationCompute CanadaDeutsche ForschungsgemeinschaftBurroughs Wellcome FundNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesMedical Research CouncilHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésProinflammatory cytokineBone marrowHaematopoiesisCancer researchOsteoporosisSkeletal disorderSomatic cellInflammationBiologyImmunologyCell biologyGeneticsStem cellGeneEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osteoporosis is caused by an imbalance of osteoclasts and osteoblasts, occurring in close proximity to hematopoietic cells in the bone marrow. Recurrent somatic mutations that lead to an expanded population of mutant blood cells is termed clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP). Analyzing exome sequencing data from the UK Biobank, we found CHIP to be associated with increased incident osteoporosis diagnoses and decreased bone mineral density. In murine models, hematopoietic-specific mutations in Dnmt3a, the most commonly mutated gene in CHIP, decreased bone mass via increased osteoclastogenesis. Dnmt3a-/- demethylation opened chromatin and altered activity of inflammatory transcription factors. Bone loss was driven by proinflammatory cytokines, including Irf3-NF-κB-mediated IL-20 expression from Dnmt3a mutant macrophages. Increased osteoclastogenesis due to the Dnmt3a mutations was ameliorated by alendronate or IL-20 neutralization. These results demonstrate a novel source of osteoporosis-inducing inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations157
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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