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Enregistrement W3208903573 · doi:10.1111/acel.13497

A trans‐omic Mendelian randomization study of parental lifespan uncovers novel aging biology and therapeutic candidates for chronic diseases

2021· article· en· W3208903573 sur OpenAlexaff
Nicolas Perrot, William Pelletier, Jérôme Bourgault, Christian Couture, Zhonglin Li, Patricia L. Mitchell, Nooshin Ghodsian, Yohan Bossé, Sébastien Thériault, Patrick Mathieu, Benoît J. Arsenault

Notice bibliographique

RevueAging Cell · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenomeBiologyMendelian randomizationGeneticsGenome-wide association studyTranscriptomeGeneDiseaseHaptoglobinMendelian inheritanceLongevityGenotypeComputational biologyBioinformaticsGene expressionGenomeSingle-nucleotide polymorphismImmunologyGenetic variantsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of parental lifespan has emerged as an innovative tool to advance aging biology and our understanding of the genetic architecture of human longevity and aging-associated diseases. Here, we leveraged summary statistics of a genome-wide association study including over one million parental lifespans to identify genetically regulated genes from the Genotype-Tissue Expression project. Through a combination of multi-tissue transcriptome-wide association analyses and genetic colocalization, we identified novel genes that may be associated with parental lifespan. Mendelian randomization (MR) analyses also identified circulating proteins and metabolites causally associated with parental lifespan and chronic diseases offering new drug repositioning opportunities such as those targeting apolipoprotein-B-containing lipoproteins. Liver expression of HP, the gene encoding haptoglobin, and plasma haptoglobin levels were causally linked with parental lifespan. Phenome-wide MR analyses were used to map genetically regulated genes, proteins and metabolites with other human traits as well as the disease-related phenome in the FinnGen cohorts (n = 135,638). Altogether, this study identified new candidate genes, circulating proteins and metabolites that may influence human aging as well as potential therapeutic targets for chronic diseases that warrant further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,140
Score d'incertitude au seuil0,414

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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