MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3210161753 · doi:10.1038/s41467-021-26526-y

The Q61H mutation decouples KRAS from upstream regulation and renders cancer cells resistant to SHP2 inhibitors

2021· article· en· W3210161753 sur OpenAlexafffund
Teklab Gebregiworgis, Yoshihito Kano, Jonathan St‐Germain, Nikolina Radulovich, Molly L. Udaskin, Ahmet Mentes, Richard Huang, Betty Poon, Wenguang He, Ivette Valencia-Sama, Claire M. Robinson, Melissa Huestis, Jinmin Miao, Jen Jen Yeh, Meredith S. Irwin, Jeffrey E. Lee, Ming‐Sound Tsao, Brian Raught, Christopher B. Marshall, Michael Ohh, Mitsuhiko Ikura

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteJapan Society for the Promotion of ScienceCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésMutationKRASUpstream (networking)CancerGeneticsCancer researchBiologyComputational biologyComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer cells bearing distinct KRAS mutations exhibit variable sensitivity to SHP2 inhibitors (SHP2i). Here we show that cells harboring KRAS Q61H are uniquely resistant to SHP2i, and investigate the underlying mechanisms using biophysics, molecular dynamics, and cell-based approaches. Q61H mutation impairs intrinsic and GAP-mediated GTP hydrolysis, and impedes activation by SOS1, but does not alter tyrosyl phosphorylation. Wild-type and Q61H-mutant KRAS are both phosphorylated by Src on Tyr32 and Tyr64 and dephosphorylated by SHP2, however, SHP2i does not reduce ERK phosphorylation in KRAS Q61H cells. Phosphorylation of wild-type and Gly12-mutant KRAS, which are associated with sensitivity to SHP2i, confers resistance to regulation by GAP and GEF activities and impairs binding to RAF, whereas the near-complete GAP/GEF-resistance of KRAS Q61H remains unaltered, and high-affinity RAF interaction is retained. SHP2 can stimulate KRAS signaling by modulating GEF/GAP activities and dephosphorylating KRAS, processes that fail to regulate signaling of the Q61H mutant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,490
Score d'incertitude au seuil0,547

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetProtein Tyrosine PhosphatasesTravaux en français237 207