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Enregistrement W3210276922 · doi:10.1681/asn.20213210s159a

Kidney Injury Molecule 1 Is a Receptor for SARS-CoV-2 in Lung and Kidney

2021· article· en· W3210276922 sur OpenAlexaff
Takaharu Ichimura, Philipp Aschauer, Robert F. Padera, Astrid Weins, Gregory A. Dekaban, Jimmy D. Dikeakos, Mahmoud L. Nasr, Joseph V. Bonventre

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKidneyLungAcute kidney injuryKidney diseaseAntibodyA549 cellBiologyHEK 293 cellsVirologyReceptorMedicineMolecular biologyPathologyImmunologyInternal medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Coronavirus disease 2019 (COVID-19) caused by SARS-CoV-2 was first reported in Wuhan in 2019 and reached pandemic proportions. SARS-CoV-2-related respiratory failure and acute kidney injury (AKI) are major complications of infection. Kidney Injury Molecule-1 (KIM-1) is a scavenger receptor expressed by kidney epithelial cells and was previously reported to be a receptor for Hepatitis virus A. We hypothesized that KIM-1 is a receptor for SARS-CoV-2 and may play an important role in COVID-19 lung and kidney injury. Methods: Human lung and kidney autopsy samples were immunostained and analyzed. Liposomal nanoparticles displaying the SARS-CoV-2 spike protein on their surface (virosomes) were generated. Virosome uptake by A549 lung epithelial cells, mouse primary lung epithelial cells and human kidney tubuloids (3D structures of kidney epithelial cells) was evaluated in the presences or absence of anti-KIM-1 antibody or TW-37, a small molecule inhibitor of KIM-1-mediated endocytosis that we discovered. Protein-protein interaction characteristics between purified SARS-CoV-2 spike protein and purified KIM-1 were determined using microscale thermophoresis. HEK293 cells expressing human KIM-1 but not angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) were infected with live SARS-CoV-2 or pseudovirions expressing the SARS-CoV-2 spike protein. Results: KIM-1 was expressed in lung and kidney epithelial cells in COVID-19 patient autopsy samples. Human and mouse lung and kidney epithelial cells expressed KIM-1 and endocytosed spike-virosomes. Both anti-KIM-1 antibodies and TW-37 inhibited uptake. Enhanced KIM-1 expression by human kidney tubuloids increased virosome uptake. KIM-1 positive cells expressed less ACE2. Using microscale thermophoresis, the EC50 for interaction between KIM-1 and SARS-CoV-2 spike protein and the receptor binding domain were 56.2±28.8 nM and 9.95±3.10 nM, respectively. KIM-1-expressing HEK293 cells without ACE2 expression had increased susceptibility to infection by live SARS-CoV-2 and pseudovirions expressing spike when compared with control cells. Conclusions: KIM-1 is a receptor for SARS-CoV-2 in the lung and kidney and thus, KIM-1 inhibitors such as TW-37 can be potential therapeutics and/or prophylactic agents for COVID-19. Funding: NIDDK Support, Other NIH Support - NCATS, Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,374 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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