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Enregistrement W3210797626 · doi:10.1093/aob/mcab133

Comparative phylogeography study reveals introgression and incomplete lineage sorting during rapid diversification of <i>Rhodiola</i>

2021· article· en· W3210797626 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAnnals of Botany · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMedicinal Plants and Bioactive Compounds
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesApplied Basic Research Foundation of Yunnan ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaVillum Fonden
Mots-clésBiologyIntrogressionPhylogeographyEvolutionary biologyDiversification (marketing strategy)Lineage (genetic)Coalescent theoryPhylogeneticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: Many plant taxa in the Qinghai-Tibetan Plateau (QTP) and the Hengduan Mountains (HM) radiated rapidly during the Quaternary but with frequent secondary contact between diverging populations. Incomplete lineage sorting and introgressive hybridization might be involved during the rapid radiation, but their effects on phylogeography have not been fully determined. METHODS: We investigated the chloroplast DNA (cpDNA)/internal transcribed spacer (ITS) sequence variations of 611 samples of Rhodiola bupleuroides, R. discolor, R. fastigiata and R. chrysanthemifolia from the QTP and HM to compare the phylogeographic patterns between the four species with different evolutionary histories, geographic ranges and reproductive modes. KEY RESULTS: The divergence times of these species were consistent with the last peak of in situ speciation in the HM. While closely related species exhibited different phylogeographic patterns, they shared several ribotypes and haplotypes in sympatric populations, suggesting introgressive hybridization. A significant phylogenetic discordance between ribotypes and haplotypes was detected in three species, implying incomplete lineage sorting. Rhodiola discolor houses an extraordinary richness of cpDNA haplotypes, and this finding may be attributed to adaptive radiation. CONCLUSION: In addition to geographic isolation and climate oscillations during the Quaternary, both introgressive hybridization and incomplete lineage sorting play important roles in species that experienced rapid diversification in the QTP and HM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,252
Score d'incertitude au seuil0,362

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle