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Enregistrement W3211022792 · doi:10.1101/2021.10.28.465024

Evolutionarily divergent mTOR remodels the translatome to drive rapid wound closure and regeneration

2021· preprint· en· W3211022792 sur OpenAlexfundno aff
Olena Zhulyn, Hannah D. Rosenblatt, Leila Shokat, Shizhong Dai, Duygu Kuzuoğlu‐Öztürk, Zijian Zhang, Davide Ruggero, Kevan M. Shokat, Maria Barna

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueSilk-based biomaterials and applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthHelen Hay Whitney FoundationCanadian Institutes of Health ResearchNew York Stem Cell Foundation
Mots-clésAxolotlBiologyPI3K/AKT/mTOR pathwayRegeneration (biology)Cell biologyTranslation (biology)mTORC1PolysomeSignal transductionMessenger RNARibosomeGeneticsRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract An outstanding mystery in biology is why some species, such as the axolotl, can scarlessly heal and regenerate tissues while most mammals cannot. Here, we demonstrate that rapid activation of protein synthesis is a unique, and previously uncharacterized, feature of the injury response critical for limb regeneration in the axolotl ( A. mexicanum) . By applying polysome sequencing, we identify hundreds of transcripts, including antioxidants and ribosome components, which do not change in their overall mRNA abundance but are selectively activated at the level of translation from pre-existing mRNAs in response to injury. In contrast, we show that protein synthesis is not activated in response to digit amputation in the non-regenerative mouse. We further identify the mTORC1 pathway as a key upstream signal that mediates this regenerative translation response in the axolotl. Inhibition of this pathway is sufficient to suppress translation and axolotl regeneration. Surprisingly, although mTOR is highly evolutionarily conserved, we discover unappreciated expansions in mTOR protein sequence among urodele amphibians. By engineering an axolotl mTOR in human cells, we demonstrate that this change creates a hypersensitive kinase that may allow axolotls to maintain this pathway in a highly labile state primed for rapid activation. This may underlie metabolic differences and nutrient sensing between regenerative and non-regenerative species that are key to regeneration. Together, these findings highlight the unanticipated impact of the translatome on orchestrating the early steps of wound healing in highly regenerative species and provide a missing link in our understanding of vertebrate regenerative potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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