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Enregistrement W3211360753 · doi:10.3389/ffgc.2021.765871

Quantitative Disease Resistance to White Pine Blister Rust at Southwestern White Pine’s (Pinus strobiformis) Northern Range

2021· article· en· W3211360753 sur OpenAlexaboutno aff
Jeremy S. Johnson, Richard A. Sniezko

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Forests and Global Change · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésBiologyColonizationWhite (mutation)InoculationBotanyResistance (ecology)Plant disease resistanceHorticultureEcologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

White pine blister rust, caused by the non-native, invasive fungal pathogen Cronartium ribicola, is a significant cause of mortality in white pines (Pinus subgenus Strobus) in North America. Along with climate-driven range contraction, mortality from blister rust can seriously impact the abundance and distribution of the nine white pine species native to the United States and Canada. Very little evaluation of this disease in southwestern white pine (Pinus strobiformis) has been previously undertaken, but genetic resistance to the disease has been documented, including major gene resistance (MGR) conferred by a dominant R gene. Data is emerging suggesting that the species also has quantitative disease resistance (QR). Our results suggest QR occurs at low frequency, with perhaps 10% of trees having a moderate level (> 35% survival). We assessed progeny arrays from 40 P. strobiformis families (1873 seedlings), originating from three populations, inoculated with C. ribicola. Subsequently, the seedlings were assessed for signs, symptoms and resulting impact in a common garden trial over a 7.5-year period to determine the types and frequency of resistance in a portion of this species’ range. There was a high incidence of both stem symptoms and mortality in the P. strobiformis families tested, and families ranged in survival from 0 to 84.6%. Three families had > 70% survival, representing perhaps the highest documented QR to date in a North American white pine species. Approximately 29.1% of the 441 surviving seedlings showed no stem symptoms, and of the approximately 70.8% of seedlings surviving with infections only few (24 of 316) had infections of moderate to high severity. QR traits associated with improved survival were primarily related to lower severity of infection, a reduced number of stem symptoms, and an increased number of bark reactions. Despite the high overall susceptibility, the presence of QR appears to be at a frequency and level useful to forest managers involved in restoration and reforestation efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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