MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3211906514 · doi:10.3390/jcm10215196

IRF3 Knockout Results in Partial or Complete Rejection of Murine Mesothelioma

2021· article· en· W3211906514 sur OpenAlexaff
Masaya Aoki, Licun Wu, Junichi Murakami, Yidan Zhao, Hana Yun, Marc de Perrot

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesPrincess Margaret Hospital FoundationBrown University
Mots-clésMedicineMesotheliomaKnockout mouseCancer researchImmunologyPathologyInternal medicineReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Malignant pleural mesothelioma (MESO) has a poor prognosis despite aggressive treatment with surgery, radiation and chemotherapy, and novel therapeutic approaches are needed. IRF3 is a downstream molecule of the cGAS/STING signaling pathway, but its roles have not been investigated in MESO. Methods: Various murine mesothelioma cell lines were inoculated into wild type (WT) and IRF3 knockout (IRF3KO) mice to compare tumor growth. AE17-bearing mice were treated with local radiotherapy (LRT) to evaluate the effect on tumor growth, and immune cell infiltration was analyzed by flow cytometry 20 days after tumor inoculation. TCGA data were used to examine the relationship between mRNA expression of IRF3 and genes of the cGAS/STING signaling cascade on prognosis in MESO. Correlations between gene expression of IRF3, cGAS/STING signaling pathway, and immune checkpoints were analyzed in TCGA MESO and our scRNA-Seq data from MESO patients. Results: In mouse mesothelioma models, AK7, RN5 and ZiP3 were completely rejected in IRF3KO mice 20 days after the tumor challenge. AE17tumor volume was slightly larger than WT mice around day 10 before shrinking and becoming significantly smaller than WT mice on day 20. LRT accelerated tumor shrinkage of AE17 tumors in IRF3KO mice. Compared with WT mice, the number of macrophages infiltrating the tumor of IRF3KO mice was significantly reduced, and CD4+ T cells and CD8+IFNγ+ T cells were significantly increased. TCGA data showed that IRF3 expression was an unfavorable prognostic factor in MESO patients. IRF3 expression, the cGAS/STING signaling pathway, and immune checkpoints were positively correlated. Conclusion: IRF3 could play a critical role in the tumor immune microenvironment of MESO.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,424
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical MedicineMême sujetinterferon and immune responsesTravaux en français237 207