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Enregistrement W3212234179 · doi:10.3389/fmars.2021.766282

Sequestration and Cyanobacterial Diet Preferences in the Opisthobranch Molluscs Dolabrifera nicaraguana and Stylocheilus rickettsi

2021· article· en· W3212234179 sur OpenAlexafffund
Angela Capper, Wei-Ting Liu, Amanda M. Fenner, Alejandro Almanza, Gina Della Togna, Liuris Herrera, Timothy Johns, Valerie J. Paul, Pieter C. Dorrestein, Todd L. Capson, Marcy J. Balunas

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Marine Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSmithsonian Tropical Research InstituteUniversidad de GuadalajaraFogarty International CenterMcGill UniversityUniversity of California, San DiegoSmithsonian Institution
Mots-clésLyngbyaBiologyPanamaCyanobacteriaZoologyEcologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A multidisciplinary approach was used to assess chemical ecological dietary interactions between marine organisms as a tool to isolate novel ecologically relevant compounds with biotechnological potential. First, laboratory-based feeding preference assays of the sea hareDolabrifera nicaraguana(previously known asD. dolabrifera), an anaspidean mollusc, were conducted by simultaneously offering six food options collected from nearby tidal pools in the Coiba National Park in the Tropical Eastern Pacific of Panama. An evaluation of preferred dietary repertoire revealedD. nicaraguanasignificantly preferred cf.Lyngbyasp. over the cyanobacteriumSymplocasp., green algaChaetomorphasp., and red algaSpyridiasp. A no-choice feeding assay using cf.Lyngbyasp. or green algaCladophorasp. supported this finding. Secondly, we conducted bioactivity-guided fractionation using the preferred food source ofD. nicaraguana, the ‘hair-like” cf.Lyngbyasp. from which we also isolated and elucidated two new depsipeptide compounds, veraguamide M (1) and veraguamide N (2). Veraguamides M (1) and N (2) showedin vitroactivity toward the malaria-causing parasitePlasmodium falciparumwith GI50values of 4.2 and 4.3 μM, respectively, and therapeutic windows of 7.0–8.0 (based on moderate cytotoxicities to mammalian Vero cells with GI50values of 29.3 and 34.1 μM, respectively). Veraguamide N (2) was also active againstLeishmania donovani, the causative agent of visceral leishmaniasis, with a GI50value of 6.9 μM. We then evaluated sequestration of these new compounds byD. nicaraguanaused in the feeding assays and found trace amounts of the dietary sequestered compounds. Finally, we evaluated sequestration of these new compounds by the sea hareStylocheilus rickettsi(previously known asS. striatus) that were grazing on the cf.Lyngbyasp. used in the feeding assays and found both to be sequestered. This study is the first example whereby compounds with significant activity against tropical parasites have been found in both the sea hareS. rickettsiand its cyanobacterial food source. These results suggest that chemical ecological studies involving sea hares and cyanobacteria continue to provide a diverse source of bioactive compounds with biotechnological potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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