Identifying the Nuclear Localization Signal of the Arabidopsis Thaliana MADS Box Transcription Factor Flowering Locus C
Notice bibliographique
Résumé
The goal of this undergraduate honours research project is to design a research strategy to identify the Nuclear Localization Signal (NLS) of the Arabidopsis thaliana MADs box transcription factor Flowering Locus C (FLC), and to begin the cloning and plant transformation of key controls required for this objective. Nuclear localization of proteins requires a specific amino acid sequence, called the Nuclear Localization Signal (NLS). The NLS of FLC has not yet been characterized, though previous work on Arabidopsis has established conserved structural-functional domains within FLC. The NLS within other MADs box proteins varies in its specific sequence, but is generally located within the MADs box domain around the N-terminal region of the polypeptide, which is a conserved region amongst MADs box proteins. I have created an FLC gene construct to be used with the GreenGate cloning system which will ultimately serve as a positive control showing nuclear localization in planta. I have also established the components necessary for the creation of a negative control line of Arabidopsis expressing GFP alone, which is not expected to nuclearly localize. Finally, I have completed a literature review to explore the existing understanding of NLS structure in general, in MADs box transcription factor proteins, and in other plant transcription factors, to propose mutations that might disrupt the NLS sequence within FLC. This work aims to fill a knowledge gap in regards to the mechanism of nuclear localization of FLC and will ultimately contribute to our understanding of nuclear localization in general. Department: Biology Faculty Mentor: Dr. Melissa Hills
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».