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Enregistrement W3214066594 · doi:10.1101/2021.11.12.468344

<i>Mycobacterium tuberculosis</i> senses host Interferon-γ via the membrane protein MmpL10

2021· preprint· en· W3214066594 sur OpenAlexaff
Mohamed I. M. Ahmed, Jared S. Mackenzie, Robert Krause, Barry Truebody, Liku B. Tezera, Diana J. Garay‐Baquero, Andrés F. Vallejo, Katya Govender, John Adamson, Paul Elkington, Adrie J. C. Steyn, Alasdair Leslie

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthUniversity of SouthamptonWellcome Trust
Mots-clésMycobacterium tuberculosisMicrobiologyVirulenceBiologyImmune systemInterferonTuberculosisInterferon gammaIsoniazidVirologyComplementationTuberculosis vaccinesMycobacteriumBacteriaGeneMutantImmunologyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is one of the most successful human pathogens and remains a leading cause of death from infectious disease. Interferon-γ (IFN-γ) is a central regulator of the immune defense against Mtb . Several cytokines have been shown to increase virulence of other bacterial pathogens, leading us to investigate whether IFN-γ has a direct effect on Mtb . We found that both recombinant and T-cell derived IFN-γ rapidly induced a dose-dependent increase in the oxygen consumption rate (OCR) of Mtb , consistent with increased bacterial respiration. This was also observed in clinical strains, but not in the vaccine strain Bacillus Calmette–Guérin (BCG), and did not occur for other cytokines tested, including TNF-α. IFN-γ binds to the cell surface of intact Mtb , but not BCG, whilst TNF-α binds to neither. Mass spectrometry analysis identified mycobacterial membrane protein large 10 (MmpL10) as the transmembrane binding partner. Consistent with this, IFN-γ binding and the OCR response was absent in a Mtb Δmmpl10 strain and restored by complementation of the mutant strain. RNA-sequencing of IFN-γ exposed Mtb revealed a distinct transcriptional profile, including genes involved in virulence and cholesterol catabolism. Finally, exposure of Mtb cells to IFN-γ resulted in sterilization of bacilli treated with isoniazid (INH), indicating clearance of phenotypically resistant bacteria that persist in the presence of INH alone. Our data suggest a novel mechanism allowing Mtb to respond to host immune activation that may be important in the immunopathogenesis of TB and have use in novel eradication strategies. One-Sentence Summary IFN-γ is a critical component of effective immune defense in human tuberculosis yet its causative agent, Mycobacterium tuberculosis it able to sense this cytokine and increase virulence and respiration in response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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