F <sub>0</sub> -F <sub>1</sub> coupling and symmetry mismatch in ATP synthase resolved in every F <sub>0</sub> rotation step
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The F 0 F 1 ATP synthase, essential for cellular energy production, is composed of the F 0 and F 1 rotary motors. While both F 0 and F 1 have pseudo-symmetric structures, their symmetries do not match. How the symmetry mismatch is solved remains elusive due to missing intermediate structures of rotational steps. Here, for ATP synthases with 3- and 10-fold symmetries in F 1 and F 0 , respectively, we uncovered the mechanical couplings between F 0 and F 1 at every 36° rotation step via molecular dynamics simulations and comparison of cryo-electron microscopy structures from three species. We found that the frustration is shared by several elements. The F 1 stator partially rotates relative to the F 0 stator via elastic distortion of the b-subunits. The rotor can be distorted. The c-ring rotary angles can be deviated from symmetric ones. Additionally, the F 1 motor may take non-canonical structures relieving stronger frustration. Together, we provide comprehensive understanding to solve the symmetry mismatch.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».