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Enregistrement W3215270358 · doi:10.1073/pnas.2111946118

BAP1 forms a trimer with HMGB1 and HDAC1 that modulates gene × environment interaction with asbestos

2021· article· en· W3215270358 sur OpenAlexaff
Flavia Novelli, Angela Bononi, Qian Wang, Fang Bai, Simone Patergnani, Franz Kricek, Ellinor Haglund, Joelle Sacks Suarez, Mika Tanji, Ronghui Xu, Yasutaka Takanishi, Michael Minaai, Sandra Pastorino, Paul Morris, G Sakamoto, Harvey I. Pass, Haithem Barbour, Giovanni Gaudino, Carlotta Giorgi, Paolo Pinton, José N. Onuchic, Haining Yang, Michele Carbone

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOccupational and environmental lung diseases
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryNational Cancer InstituteUniversità degli Studi di FerraraNational Institute of Environmental Health SciencesFondazione Umberto VeronesiCenter for Theoretical Biological PhysicsGenentechNational Science FoundationAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroWelch FoundationUniversity of Hawaiʻi FoundationAndrew and Jaime Sullivan Family FoundationMinistero della SaluteU.S. Department of Defense
Mots-clésAcetylationBAP1Cancer researchMesotheliomaHMGB1HDAC1ChemistryCarcinogenesisHistoneBiologyCell biologyHistone deacetylaseGeneBiochemistryImmunologyMedicineInflammationMelanomaPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Our findings explain mechanistically the observed gene × environment (G×E) interaction in mesotheliomas occurring in carriers of heterozygous germline BAP1 mutations ( BAP1 +/− ) exposed to asbestos. The increased amount of acetylated HMGB1 can be measured in the serum and may prove useful as a diagnostic/prognostic biomarker of mesothelioma in BAP1 +/− individuals. Inhibition of HMGB1 secretion in Bap1 +/− mutant mice exposed to asbestos significantly decreased the incidence of mesothelioma and prolonged the survival of those who developed mesothelioma. This strategy may be translated to carriers of germline BAP1 mutations with the aim of decreasing their incidence of mesothelioma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,169

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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