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Enregistrement W3215295275 · doi:10.1016/j.xhgg.2021.100070

Genetic factors associated with prostate cancer conversion from active surveillance to treatment

2021· article· en· W3215295275 sur OpenAlexaff
Yu Jiang, Travis J. Meyers, Adaeze A. Emeka, Lauren Folgosa Cooley, Phillip R. Cooper, Nicola Lancki, Irene Helenowski, Linda Kachuri, Daniel W. Lin, Janet L. Stanford, Lisa F. Newcomb, Suzanne Kolb, Antonio Finelli, Neil Fleshner, Maria Komisarenko, James A. Eastham, Behfar Ehdaie, Nicole Benfante, Christopher J. Logothetis, Justin R. Gregg, Cherie Perez, Sergio Garza, Jeri Kim, Leonard S. Marks, Merdie Delfin, Danielle Barsa, Danny Vesprini, Laurence Klotz, Andrew Loblaw, Alexandre Mamedov, S. Larry Goldenberg, Celestia S. Higano, Maria Spillane, Eugenia Wu, H. Ballentine Carter, Christian P. Pavlovich, Mufaddal Mamawala, Tricia Landis, Peter R. Carroll, June M. Chan, Matthew R. Cooperberg, Janet E. Cowan, Todd M. Morgan, Javed Siddiqui, Rabia Martin, Eric A. Klein, Karen Brittain, Paige Gotwald, Daniel A. Barocas, Jennifer Gordetsky, Pam Steele, Shilajit Kundu, Jazmine Stockdale, Monique J. Roobol, Lionne D. F. Venderbos, Martin G. Sanda, Rebecca S. Arnold, Dattatraya Patil, Christopher P. Evans, Marc Dall’Era, Anjali Vij, Anthony J. Costello, Ken Chow, Niall M. Corcoran, Soroush Rais‐Bahrami, Courtney Phares, Douglas S. Scherr, Thomas R. Flynn, R. Jeffrey Karnes, Michael O. Koch, Courtney Rose Dhondt, Joel B. Nelson, Dawn McBride, Michael S. Cookson, Kelly Stratton, Stephen Farriester, Erin Hemken, Walter M. Stadler, Tuula Pera, Deimante Banionyte, Fernando J. Bianco, Stacy Loeb, Samir S. Taneja, Nataliya Byrne, Christopher L. Amling, Ann Martinez, Luc Boileau, Franklin Gaylis, Jacqueline Petkewicz, Nicholas Kirwen, Brian T. Helfand, Jianfeng Xu, Denise Scholtens, William J. Catàlona, John S. Witte

Notice bibliographique

RevueHuman Genetics and Genomics Advances · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentrePrincess Margaret Cancer CentreUniversity of British ColumbiaUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesU.S. Department of DefenseNational Heart, Lung, and Blood InstituteNorthShore University HealthSystemNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthVanderbilt University
Mots-clésProstate cancerMedicineCancerOncologyInternal medicineEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Men diagnosed with low-risk prostate cancer (PC) are increasingly electing active surveillance (AS) as their initial management strategy. While this may reduce the side effects of treatment for PC, many men on AS eventually convert to active treatment. PC is one of the most heritable cancers, and genetic factors that predispose to aggressive tumors may help distinguish men who are more likely to discontinue AS. To investigate this, we undertook a multi-institutional genome-wide association study (GWAS) of 5,222 PC patients and 1,139 other patients from replication cohorts, all of whom initially elected AS and were followed over time for the potential outcome of conversion from AS to active treatment. In the GWAS we detected 18 variants associated with conversion, 15 of which were not previously associated with PC risk. With a transcriptome-wide association study (TWAS), we found two genes associated with conversion (MAST3, p = 6.9 × 10−7 and GAB2, p = 2.0 × 10−6). Moreover, increasing values of a previously validated 269-variant genetic risk score (GRS) for PC was positively associated with conversion (e.g., comparing the highest to the two middle deciles gave a hazard ratio [HR] = 1.13; 95% confidence interval [CI] = 0.94–1.36); whereas decreasing values of a 36-variant GRS for prostate-specific antigen (PSA) levels were positively associated with conversion (e.g., comparing the lowest to the two middle deciles gave a HR = 1.25; 95% CI, 1.04–1.50). These results suggest that germline genetics may help inform and individualize the decision of AS—or the intensity of monitoring on AS—versus treatment for the initial management of patients with low-risk PC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,608

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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