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Enregistrement W3215349079 · doi:10.1177/14604582211053259

Diagnosing post-traumatic stress disorder using electronic medical record data

2021· article· en· W3215349079 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueHealth Informatics Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensUniversity of ManitobaQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedical recordGold standard (test)Predictive powerUnstructured dataChartComputer scienceMissing dataSample (material)Diagnosis codeMedicineData miningArtificial intelligenceMachine learningStatisticsBig dataInternal medicinePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study proposes a predictive model that uses structured data and unstructured narrative notes from Electronic Medical Records to accurately identify patients diagnosed with Post-Traumatic Stress Disorder (PTSD). We utilize data from primary care clinicians participating in the Manitoba Primary Care Research Network (MaPCReN) representing 154,118 patients. A reference sample of 195 patients that had their PTSD diagnosis confirmed using a manual chart review of structured data and narrative notes, and PTSD negative patients is used as the gold standard data for model training, validation and testing. We assess structured and unstructured data from eight tables in the MaPCReN namely, patient demographics, disease case, examinations, medication, billing records, health condition, risk factors, and encounter notes. Feature engineering is applied to convert data into proper representation for predictive modeling. We explore serial and parallel mixed data models that are trained on both structured and unstructured data to identify PTSD. Model performances were calculated based on a highly skewed hold-out test dataset. The serial model that uses both structured and text data as input, yielded the highest values in sensitivity (0.77), F-measure (0.76), and AUC (0.88) and the parallel model that uses both structured and text data as the input obtained the highest positive predicted value (PPV) (0.75). Diseases such as PTSD are difficult to diagnose. Information recorded in the chart note over multiple visits of the patients with the primary care physicians has higher predictive power than structured data and combining these two data types can increase the predictive capabilities of machine learning models in diagnosing PTSD. While the deep-learning model outperformed the traditional ensemble model in processing text data, the ensemble classifier obtained better results in ingesting a combination of features obtained from both data types in the serial mixed model. The study demonstrated that unstructured encounter notes enhance a model's ability to identify patients diagnosed with PTSD. These findings can enhance quality improvement, research, and disease surveillance related to PTSD in primary care populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,967
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle