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Enregistrement W3215413483 · doi:10.5539/ijb.v13n2p57

Coinfection of Bartonella spp. and Borrelia Burgdorferi in Ixodes Scapularis Using PCR Assay, a Case Study in Nova Scotia

2021· article· en· W3215413483 sur OpenAlexafffundvenueabout
James Kho, Chelsea Colbourne, Emma Bent, Amal El Nabbout, Tatiana Rossolimo

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBartonella species infections research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesDalhousie University
Mots-clésIxodes scapularisBorrelia burgdorferiBartonellaBiologyCoinfectionIxodesLyme diseaseVirologyTickBartonella henselaeMicrobiologyTick-borne diseaseIxodidaeImmunologySerologyVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coinfection of vector species can provide more insight into the complex relationship between zoonotic pathogens and its host. Ixodes scapularis (Say) or the deer-tick in particular is an important species in North America because of its exceptional ability as a vector that can transmit zoonotic diseases such as Lyme and Cat Scratch Disease (CSD). In recent years, many studies have suggested a possible link between the coinfection of Borrelia burgdorferi, the causative agent of Lyme, with other tick-borne bacteria such as Bartonella spp., the causative agent of CSD, as partly responsible for the symptoms associated with Chronic Lyme Disease or Post-Treatment Lyme Disease Syndrome. This study investigates the prevalence of Bartonella spp. and Borrelia burgdorferi in Ixodes scapularis using Polymerase Chain Reaction (PCR) assay to potentially find a link between the two of the most common tick-borne pathogens found in Nova Scotia. Standard PCR using primers targeted at the two bacterial species were conducted on 157 I. scapularis ticks collected in Nova Scotia. Overall, we found high prevalence for both bacteria at 75.16% for Bartonella spp. and 47.13% for B. burgdorferi with no significant differences between the sex of the ticks. Interestingly, all the ticks positive for B. burgdorferi were also positive for Bartonella spp. which implies that the coinfection rate between B. burgdorferi and Bartonella spp. is 47.13%. We report one of the highest coinfection rates for B. burgdorferi and Bartonella spp. in I. scapularis, consistent with the current trends of increasing tick presence in North America.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,768
Score d'incertitude au seuil0,460

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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