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Enregistrement W3216589280 · doi:10.1161/res.129.suppl_1.mp216

Abstract MP216: Identification Of Novel Phosphoprotein Signaling Pathways In Human Dilated Cardiomyopathy By Integrative Proteomic And Phosphoproteomic Analysis

2021· article· en· W3216589280 sur OpenAlexaff
Cristine J. Reitz, Marjan Tavassoli, Da Hye Kim, Sina Hadipour‐Lakmehsari, Saumya Shah, Shin‐Haw Lee, Allen C. T. Teng, Andrew Emili, Gavin Y. Oudit, Uroš Kuzmanov, Anthony O. Gramolini

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphoproteinDilated cardiomyopathyPhosphorylationPhosphoproteomicsCell biologyBiologySignal transductionColocalizationIntercalated discWnt signaling pathwayProtein phosphorylationHeart failureInternal medicineMedicineIntracellularProtein kinase A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dilated cardiomyopathy (DCM) is one of the most common causes of heart failure, yet the majority of the underlying signaling mechanisms remain poorly characterized. Protein phosphorylation is a key regulatory element with profound effects on the activity and function of signaling networks; however, there is a lack of comprehensive phosphoproteomic studies in human DCM patients. We assessed the hypothesis that an integrative phosphoproteomics analysis of human DCM would reveal novel phosphoprotein candidates involved in disease pathophysiology. Combined proteomic and phosphoproteomic analysis of explanted left ventricular tissue samples from DCM patients ( n =4) and non-failing controls ( n =4) identified 5,570 unique proteins with 13,624 corresponding phosphorylation sites. From these analyses, we identified αT-catenin as a unique candidate protein with a cluster of 4 significantly hyperphosphorylated sites in DCM hearts ( P <0.0001), with no change in total αT-catenin expression at the protein level. Bioinformatics analyses of human datasets and confocal imaging of human and mouse cardiac tissue show highly cardiac-enriched expression of αT-catenin, localized to the cardiomyocyte intercalated disc. High resolution 3-dimensional reconstruction shows elongated intercalated disc morphology in DCM hearts (10.07±0.76 μm in controls vs. 17.20±1.87 μm in DCM, P <0.05, n =3/group), with significantly increased colocalization of αT-catenin with the intercalated disc membrane protein N-cadherin (Pearson’s coefficient 0.55±0.04 in controls vs. 0.71±0.02 in DCM, P <0.05, n =3/group). To investigate the functional role of cardiac αT-catenin phosphorylation, we overexpressed WT protein vs. non-phosphorylatable forms based on the loci identified in DCM hearts, in adult mouse cardiomyocytes using lentiviral transduction. Confocal imaging revealed significant internalization of the phospho-null form, as compared to the prominent intercalated disc staining of the WT protein (17.78±0.79% of WT vs. 9.25±0.49% of 4A mutant, P <0.0001, n =50 cells/group). Together, these findings suggest a critical role for αT-catenin phosphorylation in maintaining cardiac intercalated disc organization in human DCM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,385
Score d'incertitude au seuil0,725

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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