MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3216820798 · doi:10.1161/circ.144.suppl_1.10659

Abstract 10659: Blood DNA Methylation at TXNIP and Glycemic Changes in Response to Weight-Loss Diet Interventions: The POUNDS Lost Trial

2021· article· en· W3216820798 sur OpenAlexaff
Xiang Li, Xiaojian Shao, Qiaochu Xue, Elin Grundberg, George A. Bray, Frank M. Sacks, Lu Qi

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTXNIPMedicineWeight lossdNaMGlycemicInternal medicinePrediabetesEndocrinologyDNA methylationOverweightGlucose homeostasisType 2 diabetesInsulin resistanceMethylationDiabetes mellitusObesityBiologyGeneticsOxidative stress

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Thioredoxin Interacting Protein ( TXNIP ) functions as a master regulator for glucose homeostasis. Hypomethylation at the 5'-cytosine-phosphate-guanine-3' (CpG) site cg19693031 of TXNIP has been consistently related to islet dysfunction, hyperglycemia, and type 2 diabetes. DNA methylation (DNAm) may reveal the missing mechanistic link between obesity and type 2 diabetes; however, little is known about whether the DNAm level at TXNIP in blood is associated with glycemic changes in response to weight-loss diet interventions. Hypothesis: We hypothesized that participants with varying DNAm level of TXNIP responded differentially to weight-loss diet interventions on glycemic changes. Method: We included 639 overweight and obese participants from Preventing Overweight Using Novel Dietary Strategies (POUNDS Lost) trial, who were randomly assigned to 1 of 4 weight-loss diets varying in macronutrient contents. Blood DNAm levels were profiled by a high-resolution methylC-capture sequencing at baseline. We defined regional methylation level of TXNIP as average methylation level over CpGs within 500 bp of cg19693031. Results: Higher regional methylation level at TXNIP was correlated with lower fasting glucose, HbA1c, and Homeostatic Model Assessment of Insulin Resistance (HOMA-IR) at baseline (p<0.05 for all). Participants with distinct regional methylation level of TXNIP showed significantly different changes in fasting insulin (p-interaction=0.007) and HOMA-IR (p-interaction=0.009) in response to average- vs. high-protein diet intervention at 6 months, independent of weight loss. Among participants with an average-protein diet, higher regional methylation level at TXNIP was associated with a greater reduction of fasting insulin and HOMA-IR at 6 months, while an opposite association was found among those with a high-protein diet. Such difference was attenuated to be nonsignificant at 2 years. Conclusions: DNAm level at TXNIP in blood may modify the effects of diet interventions on changes in glycemic traits, independent of weight loss. Overweight and obese individuals with higher methylation level at TXNIP may benefit more in improving insulin and HOMA-IR by consuming an average-protein diet than a high-protein diet.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCirculation→Même sujetEpigenetics and DNA Methylation→Travaux en français237 207→