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Enregistrement W32653155 · doi:10.1016/j.jcjd.2020.03.013

HDAC function during chick neural tube development

2010· article· en· W32653155 sur OpenAlexvenueno aff
Christina Murko

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Diabetes · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetische Mechanismen spielen wahrend der Embryonalentwicklung eine wichtige Rolle. Das Niveau der Azetylierung von Histonen wird durch die entgegengesetzte Wirkung von Histonazetyltransferasen (HATs) und Histondeazetylasen (HDACs) reguliert. Die Wirkung dieser Enzymfamilien beeinflusst die Zugangigkeit der DNA fur Transkriptionsfaktoren und sorgt damit fur eine dynamische Regulation der Transkription. In den letzten Jahren wurde sehr viel Information uber die repressive Wirkung von HDACs in unterschiedlichen Modellsystemen bekannt. In adultem Gewebe und in Zellkultur haben verschiedene HDACs redundante Funktionen. Knockout-Mause zeigten jedoch, dass jede Histondeazetylase wahrend der Embryonalentwicklung spezifische Funktionen ausubt. Uberraschenderweise ist jedoch wenig Information uber die genaue Expression dieser Faktoren wahrend der Mausentwicklung bekannt. Weiters sind die HDACs im Huhn bisher ganzlich uncharakterisiert. Aus diesem Grund fuhrten wir eine genaue Expressionsanalyse von Klasse I HDACs wahrend der fruhen Maus- und Huhnerembryogenese durch. Dabei zeigte sich eine sehr spezifische Expression fur die einzelnen Faktoren. Der Grosteil des Expressionsmusters ist konserviert zwischen Maus und Huhn. Fur gewisse Regionen stellten wir jedoch merkliche Unterschiede fest. Am auffalligsten war die spezifische Lokalisation von Hdac1 im posterioren offenen Neuralrohr des Huhnerembryos. Interessanterweise verschwindet diese Expression wahrend des Neuralrohrverschlusses. Zur naheren Untersuchung der Funktion von Hdac1 in diesem Bereich wurden Embryos in ovo mit den HDAC-Inhibitoren Trichostatin A (TSA) und MS275 behandelt. Weiters wurden Hdac1 und 2 spezifisch mittels RNA-Interferenz ausgeschaltet. Als Resultat dieser Versuche konnten wir diverse Neuralrohrverschlussstorungen feststellen, wobei der starkste Phanotyp nach TSA Behandlung auftrat. Weitere Analysen zeigten eine leichte Veranderung der Proliferations- und Apoptoseraten, ohne jedoch die Gesamtzellzahl zu verandern. Um festzustellen welche Gene durch HDAC-Inhibierung dereguliert wurden, untersuchten wir die Expression von diversen Markern mittels Real time PCR, RNA in situ Hybridisierung sowie Immunfarbung. Dabei entdeckten wir die meisten Veranderungen in der Expression von Genen, die fur die Entstehung der Neuralleistenzellen von Bedeutung sind, einhergehend mit einer Reduktion der N-Cadherin Expression im Neuralrohr. Unsere Daten zeigen, dass HDACs eine wichtige Rolle in der Regulation von Neuralleistenbildung und Neuralrohrverschluss spielen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
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