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Enregistrement W4200011861 · doi:10.1097/brs.0000000000004308

Automated Segmentation of Spinal Muscles From Upright Open MRI Using a Multiscale Pyramid 2D Convolutional Neural Network

2021· article· en· W4200011861 sur OpenAlexaff
Benjamin Dourthe, Noor Shaikh, Anoosha Pai S, Sidney Fels, Stephen H.M. Brown, David R. Wilson, John Street, Thomas R. Oxland

Notice bibliographique

RevueSpine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueScoliosis diagnosis and treatment
Établissements canadiensUniversity of GuelphInternational Collaboration On Repair DiscoveriesSpinal Cord Injury BCUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineSørensen–Dice coefficientSegmentationMagnetic resonance imagingConvolutional neural networkSupine positionArtificial intelligenceLumbarImage segmentationPattern recognition (psychology)AnatomyRadiologyComputer scienceSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

STUDY DESIGN: Randomized trial. OBJECTIVE: To implement an algorithm enabling the automated segmentation of spinal muscles from open magnetic resonance images in healthy volunteers and patients with adult spinal deformity (ASD). SUMMARY OF BACKGROUND DATA: Understanding spinal muscle anatomy is critical to diagnosing and treating spinal deformity.Muscle boundaries can be extrapolated from medical images using segmentation, which is usually done manually by clinical experts and remains complicated and time-consuming. METHODS: Three groups were examined: two healthy volunteer groups (N = 6 for each group) and one ASD group (N = 8 patients) were imaged at the lumbar and thoracic regions of the spine in an upright open magnetic resonance imaging scanner while maintaining different postures (various seated, standing, and supine). For each group and region, a selection of regions of interest (ROIs) was manually segmented. A multiscale pyramid two-dimensional convolutional neural network was implemented to automatically segment all defined ROIs. A five-fold crossvalidation method was applied and distinct models were trained for each resulting set and group and evaluated using Dice coefficients calculated between the model output and the manually segmented target. RESULTS: Good to excellent results were found across all ROIs for the ASD (Dice coefficient >0.76) and healthy (dice coefficient > 0.86) groups. CONCLUSION: This study represents a fundamental step toward the development of an automated spinal muscle properties extraction pipeline, which will ultimately allow clinicians to have easier access to patient-specific simulations, diagnosis, and treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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