PITA, a pre-bilaterian p75NTR, is the evolutionary ancestor of TNF receptors
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Tumor necrosis factor receptors (TNFRs) regulate a diverse array of biological functions, including adaptive immunity, neurodevelopment, and many others. Although TNFRs are expressed in all metazoan phyla, a coherent model of the molecular origins of mammalian TNFRs—and how they relate to TNFRs in other phyla—has remained elusive. To address this, we executed a large-scale, systematic Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)-based approach to trace the evolutionary ancestry of all 29 human TNFRs. We discovered that all human TNFRs are descendants of a single pre-bilaterian TNFR with strong sequence similarity to the p75 neurotrophin receptor (p75NTR), which we designate as PITA for ‘ p75NTR is the TNFR Ancestor ’. A distinct subset of human TNFRs—including EDAR, XEDAR and TROY—share a unique history as descendants of EDAR-XEDAR-TROY (EXT), which diverged from PITA in a bilaterian ancestor. Most PITA descendants possess a death domain (DD) within their intracellular domain (ICD) but EXTs do not. PITA descendants are expressed in all bilaterian phyla and Cnidaria, but not in non-planulozoan ParaHoxozoa, suggesting that PITA originated in an ancestral planulozoan. Drosophila melanogaster TNFRs (Wengen (Wgn) and Grindelwald (Grnd)) were identified as divergent PITA descendants, providing the first evolutionary link between this model TNFR system and the mammalian TNFR superfamily. This study reveals PITA as the ancestor to human and Drosophila TNFR systems and describes an evolutionary model that will facilitate deciphering TNF-TNFR functions in health and disease.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».