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Enregistrement W4200124817 · doi:10.1109/bibe52308.2021.9635177

Learning Similarity via Subjective Evaluations and Deep Features of Histopathology Images

2021· article· en· W4200124817 sur OpenAlexaff
S. Maryam Hosseini, Morteza Babaie, Hamid R. Tizhoosh

Notice bibliographique

Revue2021 IEEE 21st International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSimilarity (geometry)Artificial intelligenceComputer sciencePattern recognition (psychology)InferenceEuclidean distanceFuzzy logicImage (mathematics)Computer visionMachine learningData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Visual similarity estimation for histopathology images plays a key role in many medical imaging tasks, especially in image search and retrieval. All image similarity evaluation approaches employ distance-based metrics to quantify the degree of (dis) similarity. However, it has always been challenging to numerically estimate the similarity between two images, which is compatible with subjective assessment of the human operator, i.e., physicians such as radiologists and pathologists. Relying only on distance calculations through Euclidean, Manhattan, Hamming, and cosine distances does not provide us with the result that can be translated to human judgment in linguistic terms and/or in a normalized range. There is a need for a reliable image similarity measurement compatible with the human assessment with minimum possible conflict. This work proposes a new scheme that evaluates the similarity between a pair of histopathology images close to human reasoning using a fuzzy-logic approach. To this end, we developed a web application to interface with users and to collect descriptive image similarity data for training and testing purposes. We designed an adaptive neuro-fuzzy inference system (ANFIS) to model the vague and uncertain nature of user image assessment for the histopathology image comparison task. The experimental results show that the trained ANFIS can estimate the image similarity with acceptable accuracy and consistent with the user evaluations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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