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Enregistrement W4200169654 · doi:10.1016/j.fsirep.2021.100043

Innate response of rainbow trout gill epithelial (RTgill-W1) cell line to ultraviolet-inactivated VHSV and FliC and rhabdovirus infection

2021· article· en· W4200169654 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFish and Shellfish Immunology Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of GuelphHuntsman Marine Science Centre
Organismes subventionnairesMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs
Mots-clésBiologyInnate immune systemFlagellinVirologyEdwardsiella tardaMicrobiologyVirusIRF7Cell cultureTLR5CarpInfectious hematopoietic necrosis virusImmune systemIRF3GeneTLR2Rainbow troutImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gills reportedly play a crucial role in induction of an antiviral immune response in fish. We investigated the expression of innate response genes in the rainbow trout gill epithelial cell line RTgill-W1 36 h after pretreatment with ultraviolet-inactivated viral hemorrhagic septicemia virus (UV-VHSV), flagellin C protein from Edwardsiella tarda (FliC), VHSV and SVCV using an Agilent 4 × 44k cGRASP salmonid microarray. RTgill-W1 cells pretreated with UV-VHSV, triggered an independent gene expression profile from those treated with a recombinant flagellin C protein from Edwardsiella tarda. In addition, exposure of RTgill-W1 cells to live viruses spring viremia of carp virus and viral hemorrhagic septicemia virus induced a less robust transcriptional change of 24 and 22 gene probes, respectively, when compared to 123 genes for UV-VHSV. Further the pretreatment of RTgill-W1 cells with (UV-VHSV) significantly reduced VHSV genome copy number at 6 d post infection (dpi) relative to the FliC-treated and untreated control. A quantitative PCR was used to study the transcriptional modulation of a set of 25 innate immune-related genes highlighted by the microarray data and a panel of 7 established antiviral genes in the protected cells. Notably, the expression of ifn1, ifn2, mx1 and mx3 were expressed more in untreated cells than in UV-VHSV-treated cells where virus replication was inhibited. The results from this study shed light on the mechanisms and pathways used by teleost gill epithelium innate immunity in combating viral and bacterial infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,356
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle