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Enregistrement W4200171412 · doi:10.1101/2021.12.01.470673

Fast volumetric imaging with line-scan confocal microscopy by an electro-tunable lens

2021· preprint· en· W4200171412 sur OpenAlexaff
Khuong Duy Mac, Muhammad Mohsin Qureshi, Myeongsu Na, Sunghoe Chang, Hyuk‐Sang Kwon, Tae Joong Eom, H. Shawn Je, Young Ro Kim, Euiheon Chung

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueElectrowetting and Microfluidic Technologies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNational Medical Research CouncilMedical Research CouncilNational Research Foundation of KoreaMinistry of Trade, Industry and EnergyKorea Medical Device Development FundNational Research FoundationMinistry of Science and ICT, South KoreaMinistry of Food and Drug SafetyNational Science Foundation
Mots-clésConfocal microscopyLens (geology)ConfocalMicroscopyOpticsVisualizationMaterials scienceClearanceLight sheet fluorescence microscopyMicroscopeBiomedical engineeringComputer scienceVolume (thermodynamics)Artificial intelligenceScanning confocal electron microscopyPhysicsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In microscopic imaging of biological tissues, particularly real-time visualization of neuronal activities, rapid acquisition of volumetric images poses a prominent challenge. Typically, two-dimensional (2D) microscopy can be devised into an imaging system with 3D capability using any varifocal lens. Despite the conceptual simplicity, such an upgrade yet requires additional, complicated device components and suffers a reduced acquisition rate, which is critical to document neuronal dynamics properly. In this study, we implemented an electro-tunable lens (ETL) in the line-scan confocal microscopy, enabling the volumetric acquisition at the rate of 20 frames per second with the maximum volume of interest of 315 × 315 × 80 μm 3 . The axial extent of point-spread-function (PSF) was 17.6 ± 1.6 μm and 90.4 ± 2.1 μm with the ETL operating in either stationary or resonant mode, respectively, revealing significant depth elongation by the resonant mode ETL microscopy. We further demonstrated the utilities of the ETL system by volume imaging of cleared mouse brain ex vivo samples and in vivo brains. The current study foregrounds the successful application of resonant ETL for constructing a basis for a high-performance 3D line-scan confocal microscopy system, which will enhance our understanding of various dynamic biological processes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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