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Enregistrement W4200194650 · doi:10.1212/wnl.0000000000013165

Mitochondrial DNA Copy Number as a Marker and Mediator of Stroke Prognosis

2021· article· en· W4200194650 sur OpenAlexafffund
Michael Chong, Sukrit Narula, Robert W. Morton, Conor Judge, Loubna Akhabir, Nathan Cawte, Nazia Pathan, Ricky Lali, Pedrum Mohammadi‐Shemirani, Ashkan Shoamanesh, Martin O’Donnell, Salim Yusuf, Peter Langhorne, Guillaume Paré

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensMcMaster UniversityImpactThrombosis and Atherosclerosis Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBuffy coatMendelian randomizationStroke (engine)Odds ratioMedicineConfidence intervalInternal medicineMitochondrial DNAGeneticsGenotypeBiologySurgeryGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Background and Objectives</h3> Low buffy coat mitochondrial DNA copy number (mtDNA-CN) is associated with incident risk of stroke and poststroke mortality; however, its prognostic utility has not been extensively explored. Our goal was to investigate whether low buffy coat mtDNA-CN is a marker and causal determinant of poststroke outcomes using epidemiologic and genetic studies. <h3>Methods</h3> First, we performed association testing between baseline buffy coat mtDNA-CN measurements and 1-month poststroke outcomes in 3,498 cases of acute, first stroke from 25 countries from the international, multicenter case-control study Importance of Conventional and Emerging Risk Factors of Stroke in Different Regions and Ethnic Groups of the World (INTERSTROKE). Then, we performed 2-sample mendelian randomization analyses to evaluate potential causative effects of low mtDNA-CN on 3-month modified Rankin Scale (mRS) score. Genetic variants associated with mtDNA-CN levels were derived from the UK Biobank study (N = 383,476), and corresponding effects on 3-month mRS score were ascertained from the Genetics of Ischemic Stroke Functional Outcome (GISCOME; N = 6,021) study. <h3>Results</h3> A 1-SD lower mtDNA-CN at baseline was associated with stroke severity (baseline mRS score: odds ratio [OR] 1.27, 95% confidence interval [CI] 1.19–1.36; <i>p</i> = 4.7 × 10<sup>−12</sup>). Independently of baseline stroke severity, lower mtDNA-CN was associated with increased odds of greater 1-month disability (ordinal mRS score: OR 1.16, 95% CI 1.08–1.24; <i>p</i> = 4.4 × 10<sup>−5</sup>), poor functional outcome status (mRS score 3–6 vs 0–2: OR 1.21, 95% CI 1.08–1.34; <i>p</i> = 6.9 × 10<sup>−4</sup>), and mortality (OR 1.35, 95% CI 1.14–1.59; <i>p</i> = 3.9 × 10<sup>−4</sup>). Subgroup analyses demonstrated consistent effects across stroke type, sex, age, country income level, and education level. In addition, mtDNA-CN significantly improved reclassification of poor functional outcome status (net reclassification index [NRI] score 0.16, 95% CI 0.08–0.23; <i>p</i> = 3.6 × 10<sup>−5</sup>) and mortality (NRI score 0.31, 95% CI 0.19–0.43; <i>p</i> = 1.7 × 10<sup>−7</sup>) beyond known prognosticators. With the use of independent datasets, mendelian randomization revealed that a 1-SD decrease in genetically determined mtDNA-CN was associated with increased odds of greater 3-month disability quantified by ordinal mRS score (OR 2.35, 95% CI 1.13–4.90; <i>p</i> = 0.02) and poor functional outcome status (OR 2.68, 95% CI 1.05–6.86; <i>p</i> = 0.04). <h3>Discussion</h3> Buffy coat mtDNA-CN is a novel and robust marker of poststroke prognosis that may also be a causal determinant of poststroke outcomes. <h3>Classification of Evidence</h3> This study provides Class II evidence that low buffy coat mtDNA-CN (&gt;1 SD) was associated with worse baseline severity and 1-month outcomes in patients with ischemic or hemorrhagic stroke.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,277
Score d'incertitude au seuil0,798

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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