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Enregistrement W4200201503 · doi:10.1101/2021.12.22.473918

A novel zebrafish model of <i>SPEG</i> -related centronuclear myopathy (CNM): characterization and comparison with other CNM model zebrafish

2021· preprint· en· W4200201503 sur OpenAlexafffund
Karla G. Espinosa, Salma Geissah, Linda Groom, Jonathan Volaptti, Ian C. Scott, Robert T. Dirksen, Mo Zhao, James J. Dowling

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensCanada Research ChairsHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick Children
Mots-clésZebrafishBiologyPhenotypeDesminMutantMyopathyGeneticsVentriculomegalyCell biologyGeneImmunologyImmunohistochemistryFetus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Centronuclear myopathy (CNM) is a congenital neuromuscular disorder caused by pathogenic variation in genes associated with membrane trafficking and excitation-contraction coupling (ECC). Bi-allelic autosomal recessive mutations in striated muscle enriched protein kinase ( SPEG ) account for a subset of CNM patients. Previous research has been limited by the perinatal lethality of Speg knockout mice. Thus, the precise biological role of SPEG in skeletal muscle remains unknown. To address this issue, we generated zebrafish spega, spegb , and spega/spegb ( speg -DKO) mutant lines. We demonstrate that speg -DKO zebrafish faithfully recapitulate multiple phenotypes associated with human CNM, including disruption of the ECC protein machinery, dysregulation of calcium homeostasis during ECC, and impairment of muscle performance. Taking advantage of the availability of zebrafish models of multiple CNM genetic subtypes, we compared novel and known disease markers in speg -DKO with mtm1 -KO and DNM2 -S619L transgenic zebrafish. We observed desmin (DES) accumulation common to all CNM subtypes, and DNM2 upregulation in muscle of both speg -DKO and mtm1 -KO zebrafish. In all, we establish a new model of SPEG -related CNM, and identify abnormalities in this model suitable for defining disease pathomechanisms and evaluating potential therapies. Summary Statement We created a novel zebrafish speg mutant model of centronuclear myopathy that recapitulates key features of the human disorder and provides insight into pathomechanisms of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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