Reprogramming Human Adult Fibroblasts into GABAergic Interneurons
Notice bibliographique
Résumé
Direct reprogramming is an appealing strategy to generate neurons from a somatic cell by forced expression of transcription factors. The generated neurons can be used for both cell replacement strategies and disease modelling. Using this technique, previous studies have shown that γ-aminobutyric acid (GABA) expressing interneurons can be generated from different cell sources, such as glia cells or fetal fibroblasts. Nevertheless, the generation of neurons from adult human fibroblasts, an easily accessible cell source to obtain patient-derived neurons, has proved to be challenging due to the intrinsic blockade of neuronal commitment. In this paper, we used an optimized protocol for adult skin fibroblast reprogramming based on RE1 Silencing Transcription Factor (REST) inhibition together with a combination of GABAergic fate determinants to convert human adult skin fibroblasts into GABAergic neurons. Our results show a successful conversion in 25 days with upregulation of neuronal gene and protein expression levels. Moreover, we identified specific gene combinations that converted fibroblasts into neurons of a GABAergic interneuronal fate. Despite the well-known difficulty in converting adult fibroblasts into functional neurons in vitro, we could detect functional maturation in the induced neurons. GABAergic interneurons have relevance for cognitive impairments and brain disorders, such as Alzheimer's and Parkinson's diseases, epilepsy, schizophrenia and autism spectrum disorders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».