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Enregistrement W4200274519 · doi:10.1002/acn3.51476

The gut microbiota in pediatric multiple sclerosis and demyelinating syndromes

2021· article· en· W4200274519 sur OpenAlexaffabout
Helen Tremlett, Feng Zhu, Douglas L. Arnold, Amit Bar‐Or, Çharles N. Bernstein, Christine Bonner, Jessica D. Forbes, Morag Graham, Janace Hart, Natalie Knox, Ruth Ann Marrie, Ali Mirza, Julia O’Mahony, Gary Van Domselaar, E. Ann Yeh, Yinshan Zhao, Brenda Banwell, Emmanuelle Waubant

Notice bibliographique

RevueAnnals of Clinical and Translational Neurology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensManitoba HealthPublic Health Agency of CanadaUniversity of ManitobaSickKids FoundationUniversity of TorontoMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill UniversityHospital for Sick ChildrenUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLachnospiraceaeMultiple sclerosisMedicineAmplicon sequencingInternal medicineClinically isolated syndromeGastroenterologyMicrobiomeGut floraImmunologyBiologyBioinformatics16S ribosomal RNAGeneticsGeneFirmicutes

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective To examine the gut microbiota in individuals with and without pediatric‐onset multiple sclerosis (MS). Methods We compared stool‐derived microbiota of Canadian Pediatric Demyelinating Disease Network study participants ≤21 years old, with MS (disease‐modifying drug [DMD] exposed and naïve) or monophasic acquired demyelinating syndrome [monoADS] (symptom onset <18 years), and unaffected controls. All were ≥30 days without antibiotics or corticosteroids. V4 region 16S RNA gene‐derived amplicon sequence variants (Illumina MiSeq) were assessed using negative binomial regression and network analyses; rate ratios were age‐ and sex‐adjusted (aRR). Results Thirty‐two MS, 41 monoADS (symptom onset [mean] = 14.0 and 6.9 years) and 36 control participants were included; 75%/56%/58% were female, with mean ages at stool sample = 16.5/13.8/15.1 years, respectively. Nine MS cases (28%) were DMD‐naïve. Although microbiota diversity (alpha, beta) did not differ between participants ( p > 0.1), taxa‐level and gut community networks did. MS (vs. monoADS) exhibited > fourfold higher relative abundance of the superphylum Patescibacteria (aRR = 4.2;95%CI:1.6–11.2, p = 0.004, Q = 0.01), and lower abundances of short‐chain fatty acid (SCFA)‐producing Lachnospiraceae ( Anaerosporobacter ) and Ruminococcaceae ( p , Q < 0.05). DMD‐naïve MS cases were depleted for Clostridiales vadin‐BB60 (unnamed species) versus either DMD‐exposed, controls ( p , Q < 0.01), or monoADS ( p = 0.001, Q = 0.06) and exhibited altered community connectedness ( p < 10 −9 Kruskal–Wallis), with SCFA‐producing taxa underrepresented. Consistent taxa‐level findings from an independent US Network of Pediatric MS Centers case/control ( n = 51/42) cohort included >eightfold higher abundance for Candidatus Stoquefichus and Tyzzerella (aRR = 8.8–12.8, p < 0.05) in MS cases and 72%–80% lower abundance of SCFA‐producing Ruminococcaceae‐NK4A214 (aRR = 0.38–0.2, p ≤ 0.01). Interpretation Gut microbiota community structure, function and connectivity, and not just individual taxa, are of likely importance in MS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,237

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,122
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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