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Enregistrement W4200308292 · doi:10.3233/jad-201504

Association of Lipidomics Signatures in Blood with Clinical Progression in Preclinical and Prodromal Alzheimer’s Disease

2021· article· en· W4200308292 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueJournal of Alzheimer s Disease · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLipidomicsDiseaseMetabolomicsBiomarkerLipid metabolismPeripheral bloodAssociation (psychology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Lipidomics may provide insight into biochemical processes driving Alzheimer's disease (AD) pathogenesis and ensuing clinical trajectories. OBJECTIVE: To identify a peripheral lipidomics signature associated with AD pathology and investigate its potential to predict clinical progression. METHODS: We used Bayesian elastic net regression to select plasma lipid classes associated with the CSF pTau/Aβ42 ratio as a biomarker of AD pathology in preclinical and prodromal AD cases from the ADNI cohort. Consensus clustering of the selected lipid classes was used to identify lipidomic endophenotypes and study their association with clinical progression. RESULTS: In the APOE4-adjusted model, ether-glycerophospholipids, lyso-glycerophospholipids, free-fatty acids, cholesterol esters, and complex sphingolipids were found to be associated with the CSF pTau/Aβ42 ratio. We found an optimal number of five lipidomic endophenotypes in the prodromal and preclinical cases, respectively. In the prodromal cases, these clusters differed with respect to the risk of clinical progression as measured by clinical dementia rating score conversion. CONCLUSION: Lipid alterations can be captured at the earliest phases of AD. A lipidomic signature in blood may provide a dynamic overview of an individual's metabolic status and may support identifying different risks of clinical progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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