Whole-Genome Sequencing Highlights Conservative Genomic Strategies of a Stress-Tolerant, Long-Lived Scleractinian Coral, <i>Porites australiensis</i> Vaughan, 1918
Notice bibliographique
Résumé
Massive corals of the genus Porites, common, keystone reef builders in the Indo-Pacific Ocean, are distinguished by their relative stress tolerance and longevity. In order to identify genetic bases of these attributes, we sequenced the complete genome of a massive coral, Porites australiensis. We developed a genome assembly and gene models of comparable quality to those of other coral genomes. Proteome analysis identified 60 Porites skeletal matrix protein genes, all of which show significant similarities to genes from other corals and even to those from a sea anemone, which has no skeleton. Nonetheless, 30% of its skeletal matrix proteins were unique to Porites and were not present in the skeletons of other corals. Comparative genomic analyses showed that genes widely conserved among other organisms are selectively expanded in Porites. Specifically, comparisons of transcriptomic responses of P. australiensis and Acropora digitifera, a stress-sensitive coral, reveal significant differences in regard to genes that respond to increased water temperature, and some of the genes expanded exclusively in Porites may account for the different thermal tolerances of these corals. Taken together, widely shared genes may have given rise to unique biological characteristics of Porites, massive skeletons and stress tolerance.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».