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Enregistrement W4200425980 · doi:10.1016/j.neurobiolaging.2021.12.004

Genomic study of a large family with complex neurological phenotype including hearing loss, imbalance and action tremor

2021· article· en· W4200425980 sur OpenAlexafffundabout
Julien F. Bally, Ming Zhang, Emily Dwosh, Christine Sato, John Rutka, Anthony E. Lang, Ekaterina Rogaeva

Notice bibliographique

RevueNeurobiology of Aging · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensOntario Brain InstituteToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity of British Columbia HospitalToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesH. Lundbeck A/SNational Natural Science Foundation of ChinaConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementAcorda TherapeuticsSunovionFundamental Research Funds for the Central UniversitiesSun PharmaBiogenEli Lilly and Company
Mots-clésHearing lossGeneticsAllelePhenotypeLocus (genetics)PopulationSensorineural hearing lossMedicineGenetic heterogeneityAudiologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neurological disorders are often associated with a variety of symptoms, which can result from the combined action of genetic variants. We conducted a whole-genome analysis of a previously unreported unique multigenerational Dutch-Canadian family with a complex phenotype presenting with a combination of hearing loss, balance issues or action tremor. Ten family members were available for genetic study. The hearing loss and balance problems are explained by a pathogenic p.P51S substitution in COCH, which is a known founder mutation in Dutch and Belgium families affected by non-syndromic progressive sensorineural hearing loss often accompanied by vestibular dysfunction. Notably, p.P51S did not co-segregate with action tremor in our and reported kindreds. In our family, all 5 patients with tremor were carriers of the extremely rare p.R247W substitution in MCM9 (minor allele frequency in European population is 0.00003), which belongs to the top 0.1% of deleterious variants in the human genome. The MCM9 locus has not been previously associated with action tremor and deserves further investigation in future functional and genetic studies of action tremor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,235

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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