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Enregistrement W4200449008 · doi:10.1101/2021.12.03.471189

Glutamine deficiency in solid tumors confers resistance to ribosomal RNA synthesis inhibitors

2021· preprint· en· W4200449008 sur OpenAlexaff
Melvin Pan, Christiane Zorbas, Maki Sugaya, Kensuke Ishiguro, Miki Kato, Miyuki Nishida, Haifeng Zhang, Marco M. Candeias, Akimitsu Okamoto, Takamasa Ishikawa, Tomoyoshi Soga, Hiroyuki Aburatani, Juro Sakai, Yoshihiro Matsumura, Tsutomu Suzuki, Christopher G. Proud, Denis L. J. Lafontaine, Tsuyoshi Osawa

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesLife Science Foundation of JapanMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyTokyo Biochemical Research FoundationUniversity of TokyoNaito Foundation
Mots-clésRibosome biogenesisRibosomal RNARibosomeRibosomal proteinProtein biosynthesisGlutamineBiologyTranslation (biology)Cell biologyElongation factorBiogenesisEukaryotic RibosomeRNABiochemistryMessenger RNAGeneAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Ribosome biogenesis involves the processing of precursor ribosomal RNAs (pre-rRNAs) and sequential assembly with ribosomal proteins. Here we report that nutrient deprivation severely impairs pre-rRNA processing and leads to the accumulation of unprocessed rRNAs. Upon nutrient restoration, the accumulated pre-rRNAs are processed into mature rRNAs that are utilized for ribosome biogenesis. Failure to accumulate pre-rRNAs under nutrient deprivation leads to perturbed ribosome assembly during nutrient restoration and subsequent apoptosis via uL5/uL18-mediated activation of p53. Restoration of glutamine alone activates p53 by triggering uL5/uL18 translation. Induction of uL5/uL18 protein synthesis by glutamine was dependent on the translation factor eukaryotic elongation factor 2 (eEF2), which was in turn dependent on Raf/MEK/ERK signalling. Depriving cells of glutamine prevents the activation of p53 by rRNA synthesis inhibitors. Our data reveals a mechanism that cancer cells can exploit to suppress p53-mediated apoptosis during fluctuations in environmental nutrient availability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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