MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4200453028 · doi:10.31043/2410-2733-2021-3-5-14

Probability of manifestation of fertility haplotype AH1 in tested ayrshire bulls

2021· article· en· W4200453028 sur OpenAlexaboutno aff
Екатерина Николаевна Васильева

Notice bibliographique

RevueGenetics and breeding of animals · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPedigree chartSireHaplotypeBreedBiologyGeneticsAnimal scienceGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of the research is to study the probability of manifestation of the haplotype of fertility AH1 in Ayrshire sires with different variants of the presence of AH1C in male ancestors in the first four rows of their pedigree. Materials and methods. The material of the study was the data of the electronic database created at RRIFAGB on the presence of the haplotype AH1 in 74 sire of the Ayrshire breed of Russia, of which 22 are carriers of the genetic defect - AH1C, and the rest are free - AH1F. To find patterns in the manifestation of the haplotype in the tested bulls, we analyzed different variants of the presence of AH1C in male ancestors in four rows of the paternal and maternal sides of their pedigree with the calculation of the probability of its manifestation. The study used data from the electronic databases “Card file of Ayrshire bulls” and “Card file of mothers of Ayrshire bulls” prepared for selection and genetic analysis using the computer program “SGS-VNIIGRZH“ and data from the Canadian website www.cdn.ca. The strength of the influence of the factors "distance of the nearest carrier ancestor" and "number of carrier ancestors" in all ranks of the proband's pedigrees on the manifestation of the haplotype AH1 in bulls of the Ayrshire breed was calculated using ANOVA in Data Analysis of Microsoft Office Excel. Results. Among the tested livestock, 42.3% of bulls AH1F did not have male ancestors of AH1C in the pedigree, while AH1C bulls had 27.3% of them. It was found that with the nearest ancestor AH1C in the 4th row of the pedigree, the haplotype was manifested in only 8.3% of the tested sires, in the 3rd and 2nd rows - in 16.7%, and in the 1st - in 75.0%. The strength of the factor “distance of the nearest carrier ancestor” is 22.0%, while the factor “number of carrier ancestors” in all ranks of the proband's pedigrees is 21.0%. Ancestors of AH1С in the first two rows of the pedigree is a reliable indicator for identifying the fertility haplotype in a proband. The highest probability of manifestation of the AH1 in a proband is observed in the presence of carrier ancestors on both sides of the pedigree, including the father. Conclusion. To reduce the likelihood of manifestation of AH1 in a proband, it is necessary to prevent the presence of bulls carrying the fertility haplotype closer to the fourth row in his pedigree, and also to avoid in all ranks of the pedigree more than three AH1C males.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,480
Score d'incertitude au seuil0,413

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenetics and breeding of animalsMême sujetGenetic and phenotypic traits in livestockTravaux en français237 207