MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4200577883 · doi:10.26685/urncst.295

The Use of the λ Bacteriophage to Neutralize the Pathogenic Effects of Shiga Toxins from Escherichia Coli to Combat Antimicrobial Resistance: A Research Protocol

2021· article· en· W4200577883 sur OpenAlexaff
Jessica M. Karlovcec, Emma Veres, Brendan D. Paget

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEscherichia coliMicrobiologyLytic cycleShiga toxinBiologyAntibiotic resistanceAntimicrobialBacteriophageBacteriaPathogenic Escherichia coliPathogenic bacteriaReceptorAntibioticsVirologyGeneVirusGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Resistance to antibiotics is becoming a global health crisis. Certain strains of Escherichia coli bacteria are resistant to antibiotic drugs and thrive without competition. Pathogenic effects of E. coli are caused by Shiga toxins they produce. Instead of attempting to kill the pathogens, we propose altering the bacterial genome of E. coli, causing the expression of globotriaosylceramide (Gb3) receptors, effectively neutralizing produced toxins. Methods: Phages are introduced to cultured E. coli cells and incorporate their DNA into the bacterial genome. Mutation vectors are transformed into E. coli cells using electroporation, causing expression of Gb3 receptors and preventing the lysing of the cell. Next, exposure to UV light causes phages to enter the lytic cycle, and mutated phages can be collected. Then, E. coli cells will be administered to 28 Wistar rats, and phage treatments causing expression of Gb3 receptors on E. coli cells will be administered to the treatment group. Rats in both groups will be monitored for symptomatology of E. coli poisoning, and stool samples will be collected and analyzed for quantities of Shiga toxins. Anticipated Results: We anticipate that phage-treated E. coli cells will express Gb3 receptors. We expect that, in the control group, symptoms of E. coli poisoning and quantities of Shiga toxins will increase over the duration of the study. Upon adequate expression of Gb3 receptors, we expect symptoms of E. coli poisoning and quantities of Shiga toxins to be lower in the treatment group than in the control group throughout the study. Discussion: Confirmation of our anticipated results through immunofluorescence spectra visualizing Gb3 receptors, histogram plots of symptoms, and lateral flow assays detecting quantities of Shiga toxins will prove our methods to be a valuable asset for decreasing the effects of E. coli poisoning and related diseases. Conclusion: Antibiotic resistance is becoming a serious threat. As antibiotic drugs are designed to kill bacteria, we propose an alternative method to neutralizing the pathogenic effects caused by E. coli through the incorporation of Gb3 receptors, and allowing the proliferation of the bacteria. This suggests an approach to slowing the acceleration of antibiotic resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) JournalMême sujetBacteriophages and microbial interactionsTravaux en français237 207