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Enregistrement W4205236477 · doi:10.22215/etd/2021-14744

Investigating the Role of Porcupine and WNTless: Components of WNT Signalling Pathway in Response to Endoplasmic Reticulum, Oxidative, Hypoxia and Environmental Toxins Stesses

2021· dissertation· en· W4205236477 sur OpenAlexaff
Rowida Mohamed

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayWNT3ACell biologyBiologyEndoplasmic reticulumUnfolded protein responseSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Porcupine (PORCN) and WNTless (WLS) are factors that control the production of WNT; a protein involved in the early stages of colon cancer development.The WNT proteins play a role in stem cell development and cell differentiation.However, the response of PORCN and WLS to stressors remains to be studied.Previously, we investigated how modifications of PORCN and WLS result in changes in WNT expression and secretion from cells under stress conditions that are found in the tumor microenvironment (hypoxia, oxidative stress, endoplasmic reticulum (ER) stress).The mRNA and protein expression of both PORCN and WLS were notably altered with treatments in human colon cancer (HCT116) cells and human intestinal epithelial (HIEC-6) cells.Our results demonstrated significant changes in expression, which led us to investigate the role of different transcription factors during stresses including (GRP78, HIF1α, NFE2L1, NFEL2L2 and MT1).These transcription factors were altered both at levels of the translation and transcription, when overexpressed by PORCN, WLS and WNT3A.WNT and PORCN levels significantly increased at translation and transcriptional levels when overexpressed by PORCN, WLS and WNT3A.WNT and PORCN undergo palmitoyleation; a modification implicated in cancer cell signalling.The inhibition of palmitoyleation by 2-bromohexdecanoic acid (2-BHDA) resulted in a decrease in the modified forms of PORCN in HCT116 cells.Furthermore, the data showed that palmitoyleation plays an essential role in the expression of WNT proteins; specifically, inhibiting WNT3A and decreasing WLS protein expression in HCT116 cells.However, WLS and WNT3A are modified by N-linked glycosylation.Emerging evidence indicates the critical role of glycosylation in tumor aggressiveness, progression, and metastasis.Cell I would like to extend my thanks to my department.The lab coordinators Mastaneh

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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