MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4205310056 · doi:10.3410/f.1158602.618802

Faculty Opinions recommendation of Bcl-2 proteins EGL-1 and CED-9 do not regulate mitochondrial fission or fusion in Caenorhabditis elegans.

2009· dataset· en· W4205310056 sur OpenAlexfundno aff
Sharad Kumar

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2009
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUniversity of FloridaBurroughs Wellcome Fund
Mots-clésMitochondrial fissionCaenorhabditis elegansmitochondrial fusionMitochondrionCell biologyBiologyFusion proteinMutantApoptosisMitochondrial DNAFissionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Bcl-2 family proteins are critical apoptosis regulators that associate with mitochondria and control the activation of caspases.Recently, both mammalian and C. elegans Bcl-2 proteins have been implicated in controlling mitochondrial fusion and fission processes in both living and apoptotic cells.To better understand the potential roles of Bcl-2 family proteins in regulating mitochondrial dynamics, we carried out a detailed analysis of mitochondria in animals that either lose or have increased activity of egl-1 and ced-9, two Bcl-2 family genes that induce and inhibit apoptosis in C. elegans, respectively.Unexpectedly, we found that loss of egl-1 or ced-9, or overexpression of their gene products, had no apparent effect on mitochondrial connectivity or mitochondrial size.Moreover, loss of ced-9 did not affect the mitochondrial morphology observed in a drp-1 mutant, where mitochondrial fusion occurs but mitochondrial fission is defective, or in a fzo-1 mutant, where mitochondrial fission occurs but mitochondrial fusion is restricted, suggesting that ced-9 is not required for either the mitochondrial fission or fusion process in C. elegans.Taken together, our results argue against an evolutionarily conserved role for Bcl-2 proteins in regulating mitochondrial fission and fusion. RESULTS Mitochondrial morphogenesis is not affected in egl-1(lf) or ced-9(lf) mutantsRecently, the C. elegans pro-apoptotic BH3-only Bcl-2 protein EGL-1 has been implicated in promoting mitochondria fission during apoptosis [1].In addition, the C. elegans anti-apoptotic Bcl-2 protein CED-9 was shown to mediate mitochondria fission during apoptosis in one study [1] but was found to promote mitochondria fusion in healthy cells in another [2], calling into question of the exact physiological roles of C. elegans Bcl-2 family proteins in regulating mitochondria dynamics.To address the critical issue of whether Bcl-2 proteins regulate normal mitochondrial fission or fusion process in C. elegans, we carried out a comprehensive analysis of mitochondria morphology and structure in animals that either lose or have increased activity of egl-1 or ced-9.First, we visualized mitochondria in early C. elegans embryos that were

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,075

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,012

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical LiteratureMême sujetMitochondrial Function and PathologyTravaux en français237 207